RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 UBTD2Q8WUN7 234 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB8AQ96BR9 441 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FKRPQ9H9S5 495 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 Q9N2J8 555 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MED11Q9P086 117 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF639Q9UID6 485 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CUBNO60494 3623 aa7□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 DPRXA6NFQ7 191 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YC42 278 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM77I1YAP6 450 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMDEC1O15204 470 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNAB3O43448 404 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL13O43927 109 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKD3O94806 890 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SLITRK5O94991 958 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN9O95484 217 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CBX7O95931 251 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAP00813 363 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GBAP04062 536 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GFAPP14136 432 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EPORP19235 508 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GGT1P19440 569 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MPIP34949 423 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ELK3P41970 407 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH9A1P49189 494 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EMDP50402 254 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GAS1P54826 345 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CARD18P57730 90 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT88Q13099 833 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MORF4L2Q15014 288 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LGSNQ5TDP6 509 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC43A2Q8N370 569 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.99□□□□□ -1.29
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PGGT1B-201ENST00000296642 NEUROG1Q92886 237 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL8AQ96BM9 186 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C3orf49Q96BT1 292 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PBKQ96KB5 322 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MYNNQ9NPC7 610 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT9Q9Y305 439 aa6.99□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC36A6NLP5 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNH1O95259 989 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 YES1P07947 543 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A8P0DMV1 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A9P0DMV2 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 HPGDP15428 266 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK2P16519 638 aa6.98□□□□□ -1.29
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PGGT1B-201ENST00000296642 CXCR5P32302 372 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF1P41567 113 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 NR4A2P43354 598 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A8P48029 635 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 LIMS1P48059 325 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB10P61026 200 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 MGAT2Q10469 447 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4D1Q15615 310 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CARTPTQ16568 116 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 FRG2Q64ET8 278 aa6.98□□□□□ -1.29
PGGT1B-201ENST00000296642 STEAP4Q687X5 459 aa6.98□□□□□ -1.29
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