RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXO34Q9NWN3 711 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 STMN3Q9NZ72 180 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PYCR1P32322 319 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP3R1P63098 170 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CLDN22Q8N7P3 220 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 AICDAQ9GZX7 198 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF208Q9H0X6 261 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 A4GALTQ9NPC4 353 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NANSQ9NR45 359 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.24■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ALPPP05187 535 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PROS1P07225 676 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR12D2P58182 307 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 BTN3A2P78410 334 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CDS1Q92903 461 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NLGN3Q9NZ94 848 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 DKK3Q9UBP4 350 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CHST10O43529 356 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC35G4P0C7Q5 338 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 GABRA5P31644 462 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 DGCR2P98153 550 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 DSG2Q14126 1118 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OCLNQ16625 522 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 DPPA4Q7L190 304 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRC17Q8N6Y2 441 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NUP43Q8NFH3 380 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPAN4O14817 238 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SOX30O94993 753 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 HLA-DPB1P04440 258 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PSMB10P40306 273 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CDK5Q00535 292 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NNATQ16517 81 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 TP53I3Q53FA7 332 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 MPP7Q5T2T1 576 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PIGXQ8TBF5 258 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PXYLP1Q8TE99 480 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR7D2Q96RA2 312 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ALG8Q9BVK2 526 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 IFT27Q9BW83 186 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.23■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 NOTCH4Q99466 2003 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRN3E7EW58 273 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 IMPA2O14732 288 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SPINT1O43278 529 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 GAS1P54826 345 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 TAS2R38P59533 333 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTS15Q8TE58 950 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 WDFY2Q96P53 400 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FN3KQ9H479 309 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SPHK1Q9NYA1 384 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A1W2PRQ8 180 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LILRB5O75023 590 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 EPCAMP16422 314 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 C21orf58P58505 322 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAM15Q13444 863 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM109AQ8N4B1 249 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXL6Q8N531 539 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 OR11H7Q8NGC8 314 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 GDF15Q99988 308 aa16.22■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A087WV48 116 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 AIFM1O95831 613 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LATS1O95835 1130 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 LGI1O95970 557 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 BCL6P41182 706 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SMIM11AP58511 58 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB40BQ12829 278 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 SLC9A5Q14940 896 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 DHCR24Q15392 516 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 ACOT4Q8N9L9 421 aa16.21■□□□□ 0.19
KCNQ1-201ENST00000155840 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms