RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bex2Q9WTZ8 129 aa12.09□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa12.09□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1215A3KGY3 312 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh19E9Q3A7 770 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp605E9QAH2 694 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933408B17RikG3X9B4 273 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alkal1J3QPP8 127 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc22a1O08966 556 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArafP04627 604 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CtslP06797 334 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gdf7P43029 461 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MybphP70402 483 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Garem1Q3UFT3 876 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kctd21Q3URF8 260 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CstbQ62426 98 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrit2Q6PFC5 549 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il20raQ6PHB0 546 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610318N02RikQ80VT5 305 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933402N03RikQ8CDT9 329 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slco1a6Q99J94 670 aa12.08□□□□□ -0.47
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zbtb34A2ATY4 518 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r98E9PZ56 857 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr52P0C5J4 361 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LcatP16301 438 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cds1P98191 461 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mtcp1Q60945 107 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Med16Q6PGF3 828 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Npr2Q6VVW5 1047 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas2r117Q7M715 330 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr68Q8BFQ3 365 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc38a9Q8BGD6 560 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scara5Q8K299 491 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nmral1Q8K2T1 309 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lin28aQ8K3Y3 209 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc23a2Q9EPR4 648 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tuba8Q9JJZ2 449 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700023F06RikA2AB62 382 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r31L7N2F1 303 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gosr2O35166 212 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Neu1O35657 409 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Csf1P07141 552 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxc5P32043 222 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krba1Q6NXZ1 1043 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Polr2mQ6P6I6 366 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC061237Q6P8I2 184 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc35f2Q7TML3 375 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl13Q80TF4 654 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdk5rap1Q8BTW8 588 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pamr1Q8BU25 720 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PigtQ8BXQ2 582 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec2fQ8VI21 196 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hhipl2Q9D2G9 717 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CalyQ9DCA7 226 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BvesQ9ES83 358 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MthfrQ9WU20 654 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp993A2A8V4 313 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp992B1ASD8 573 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ChrndP02716 520 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P04213 122 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klkb1P26262 638 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P2ry2P35383 373 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cd63P41731 238 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pak6Q3ULB5 682 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r196Q5SVD5 301 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr503Q7TRU8 323 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hpf1Q8CFE2 346 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp991Q8R1N3 573 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smurf1Q9CUN6 731 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpvfQ9ESQ8 188 aa12.08□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gsg1lD3Z7H4 322 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r25H3BLP0 302 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fcgr3P08508 261 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gnao1P18872 354 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CpoxP36552 443 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MocosQ14CH1 862 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf43Q5NCP0 784 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamtsl4Q80T21 1036 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl48Q8JZS9 211 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nectin4Q8R007 508 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem106aQ8VC04 261 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Noxo1Q8VCM2 349 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr729Q8VET4 323 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plekhj1Q9D240 164 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DynapQ9D7M5 161 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nr4a3Q9QZB6 627 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dlgap4B1AZP2 992 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9008E9PVG0 424 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21800J3QMJ9 180 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bmp6P20722 510 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ephx2P34914 554 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspan5P62080 268 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp2cbP62715 309 aa12.07□□□□□ -0.48
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp2caP63330 309 aa12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 71.2 ms