RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SCGB1D2O95969 90 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CD8BP10966 210 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 FCGR2AP12318 317 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 RAB6AP20340 208 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 DRD5P21918 477 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 UGT2B10P36537 528 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CD79BP40259 229 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PPICP45877 212 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 EMDP50402 254 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SERPINB8P50452 374 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 MAPK12P53778 367 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SESN3P58005 492 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 B3GALT5-AS1P59052 145 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 IRF9Q00978 393 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 IFT88Q13099 833 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 TRAF3Q13114 568 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 EFR3AQ14156 821 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 GUSBP1Q15486 140 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ACKR1Q16570 336 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 KLC3Q6P597 504 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 COMMD6Q7Z4G1 85 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PLCZ1Q86YW0 608 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 METTL4Q8N3J2 472 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PPM1NQ8N819 430 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 OR52B6Q8NGF0 335 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 KCTD4Q8WVF5 259 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 NXNL1Q96CM4 212 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 KLHL29Q96CT2 875 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 TMCO6Q96DC7 493 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SFXN2Q96NB2 322 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 COL21A1Q96P44 957 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ERP44Q9BS26 406 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 MED18Q9BUE0 208 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 NTMT1Q9BV86 223 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 RNF122Q9H9V4 155 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 BRF2Q9HAW0 419 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 AHSPQ9NZD4 102 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 DKKL1Q9UK85 242 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PCTPQ9UKL6 214 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ABCG2Q9UNQ0 655 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SNX24Q9Y343 169 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ZNF175Q9Y473 711 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.96□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 A0A096LPK6 155 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 HMX2A2RU54 273 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 B4DXG7 233 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 EMC8O43402 210 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 AKAP10O43572 662 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 TSPAN2O60636 221 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 KLHL2O95198 593 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 TGM6O95932 706 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 C2P06681 752 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 KLK1P06870 262 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 RPS17P08708 135 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CT45A8P0DMV1 189 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CT45A9P0DMV2 189 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PEPDP12955 493 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 POU2F1P14859 743 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PPP3CBP16298 524 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 GRK2P25098 689 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 DPP4P27487 766 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PCSK6P29122 969 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 EVI2BP34910 448 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PAFAH1B1P43034 410 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 MAGEA12P43365 314 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 PTH2RP49190 550 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 CCNG1P51959 295 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 GAS1P54826 345 aa4.95□□□□□ -1.62
PDE4D-229ENST00000638939 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms