RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	EFR3A	Q14156	821 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NEPRO	Q6NW34	567 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	SMPDL3A	Q92484	453 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0G2JLM5	398 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ISPD	A4D126	451 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CXorf65	A6NEN9	183 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	BECN2	A8MW95	431 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CLDN25	C9JDP6	229 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061		H7BY64	318 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CCER2	I3L3R5	266 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061		M0R233	179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CEP104	O60308	925 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZIC3	O60481	467 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJA2	O60884	412 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ICOSLG	O75144	302 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	AP2A2	O94973	939 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ETHE1	O95571	254 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	IL33	O95760	270 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ACP2	P11117	423 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	RYK	P34925	604 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	GNB2	P62879	340 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ABAT	P80404	500 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CTBP1	Q13363	440 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	TTMP	Q5BVD1	217 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061		Q5VSD8	79 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	GJB7	Q6PEY0	223 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	GALNT10	Q86SR1	603 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB1C	Q92928	201 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC35C1	Q96A29	364 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PITX2	Q99697	317 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZWILCH	Q9H900	591 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	HACD3	Q9P035	362 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PRSS50	Q9UI38	385 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM129	A0AVI4	362 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	AGAP14	A8MT82	685 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CETN3	O15182	167 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CDC14B	O60729	498 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NIPSNAP2	O75323	286 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NCR1	O76036	304 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	CRYAA	P02489	173 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	DES	P17661	470 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	KRT15	P19012	456 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NT5E	P21589	574 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	RAC1	P63000	192 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NOMO3	P69849	1222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	STX4	Q12846	297 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PMS2P11	Q13670	270 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	PTPRCAP	Q14761	206 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SNAP23-222	ENST00000626061	NOMO1	Q15155	1222 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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