RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 APIPQ96GX9 242 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF382Q96SR6 550 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL4Q9C0H6 718 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 NFU1Q9UMS0 254 aa9.26□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 RTTNQ86VV8 2226 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A087WV62 115 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TRIM49D1C9J1S8 452 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF4O43474 513 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 AQP8O94778 261 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SUPT7LO94864 414 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SLITRK5O94991 958 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMG1O95456 288 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 THBDP07204 575 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 FCGR2AP12318 317 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 HMOX2P30519 316 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CASQ1P31415 396 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GSTM5P46439 218 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 HTR6P50406 440 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DECR1Q16698 335 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 UNC50Q53HI1 259 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 BEX5Q5H9J7 111 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf74Q6P047 294 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNT18Q6P9A2 607 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GGNQ86UU5 652 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL6Q8TCB7 284 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM237Q96Q45 408 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 BBS4Q96RK4 519 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 EBPLQ9BY08 206 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF180Q9UJW8 692 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 USF3Q68DE3 2245 aa9.25□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 UPK1AO00322 258 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMCC2O75069 709 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 IL33O95760 270 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP3CBP16298 524 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TAC1P20366 129 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DDCP20711 480 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 NR1H2P55055 460 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SGCBQ16585 318 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX35Q5T0J7 233 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM107Q6UX40 140 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MARCH3Q86UD3 253 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2L13Q8N349 312 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 OR6K3Q8NGY3 331 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 Q9N2J8 555 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 EMC9Q9Y3B6 208 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR14LQ5THK1 2151 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SERTM1A2A2V5 107 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 HS3ST1O14792 307 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 DLX3O60479 287 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ANGPTL1O95841 491 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 PLAUP00749 431 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF17P17021 662 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-226ENST00000593200 IL11P20809 199 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms