RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587259.5

VMP1-204, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene VMP1, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-204ENST00000587259 SOAT1P35610 550 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CD96P40200 585 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 RFC3P40938 356 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 PRIM2P49643 509 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GZMMP51124 257 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ARHGDIAP52565 204 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 PLA2G16P53816 162 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 HBA1P69905 142 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 PRR5P85299 388 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TLE4Q04727 773 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SLAMF1Q13291 335 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TUBA3CQ13748 450 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SELPLGQ14242 412 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 RGNQ15493 299 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 NDUFA9Q16795 377 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 BTBD16Q32M84 506 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 RPTNQ6XPR3 784 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CDH24Q86UP0 819 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZZZ3Q8IYH5 903 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 NEURL3Q96EH8 262 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 MAGED4Q96JG8 741 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 OR2A5Q96R48 311 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 BBS4Q96RK4 519 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 IKZF5Q9H5V7 419 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 LYRM4Q9HD34 91 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 MEMO1Q9Y316 297 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CACNA1CQ13936 2221 aa7.25□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ADAM10O14672 748 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TMPRSS11DO60235 418 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 DNAJB6O75190 326 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TIPRLO75663 272 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SOX30O94993 753 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CLDN14O95500 239 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 AGR2O95994 175 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 HPRP00739 348 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SERPINA1P01009 418 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GBAP04062 536 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ITGA2P17301 1181 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GPC1P35052 558 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CRATP43155 626 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 KHKP50053 298 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 DSTNP60981 165 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TNFRSF17Q02223 184 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 HYAL2Q12891 473 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GAB1Q13480 694 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 OR1C1Q15619 314 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CEBPEQ15744 281 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 INAQ16352 499 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 32.6
VMP1-204ENST00000587259 RFX4Q33E94 735 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GTDC1Q4AE62 458 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 MINDY4Q4G0A6 757 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZNF385BQ569K4 471 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ACER2Q5QJU3 275 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GARNL3Q5VVW2 1013 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 LPCAT4Q643R3 524 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 SLC48A1Q6P1K1 146 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 XKRXQ6PP77 449 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 TMEM205Q6UW68 189 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 CCDC80Q76M96 950 aa7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
VMP1-204ENST00000587259 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms