RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF292O60281 2723 aa7.85□□□□□ -1.15
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.84□□□□□ -1.15
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCB7O75027 752 aa7.84□□□□□ -1.15
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN2O60636 221 aa7.83□□□□□ -1.16
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD247P20963 164 aa7.83□□□□□ -1.16
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCN1P31025 176 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRKAR1BP31321 381 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOX3P41225 446 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCNJ5P48544 419 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLK3P49761 638 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL11P51671 97 aa7.83□□□□□ -1.16
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