RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRRC4Q9HBW1 653 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL28Q9NXS3 571 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEC14L4Q9UDX3 406 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF639Q9UID6 485 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABCG2Q9UNQ0 655 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 STK38LQ9Y2H1 464 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNF115Q9Y4L5 304 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 ALG6Q9Y672 507 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 NINLQ9Y2I6 1382 aa2.65□□□□□ -1.98
RNU6-928P-201ENST00000516876 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1B0GVL5 298 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 TUBAL3A6NHL2 446 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 MSGN1A6NI15 193 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM74A7A6NL05 159 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANHXE9PGG2 379 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 C11orf98E9PRG8 122 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 F5H6K3 240 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 TM9SF1O15321 606 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARHGEF9O43307 516 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPIHO43447 177 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 UPK3AO75631 287 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 UGT2B17O75795 530 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 BBOX1O75936 387 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRT34O76011 436 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 AP2A2O94973 939 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 FTH1P02794 183 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 IGF1P05019 195 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYP2B6P20813 491 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 EDNRAP25101 427 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP2R1BP30154 601 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 YWHABP31946 246 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 BMI1P35226 326 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 GNPDA1P46926 289 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD151P48509 253 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 CASP4P49662 377 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDLIM4P50479 330 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAX9P55771 341 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 XGP55808 180 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAG2P55895 527 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPS15P62841 145 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLRC3Q07444 240 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RGS1Q08116 209 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 CRMP1Q14194 572 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 STK38Q15208 465 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ETFDHQ16134 617 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC15A2Q16348 729 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ECSCRQ19T08 205 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL38Q2WGJ6 581 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 GTDC1Q4AE62 458 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 GGTA1PQ4G0N0 100 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM74A3Q4VXF1 159 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 WDR38Q5JTN6 314 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLX4IPQ5VYV7 408 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR2A2Q6IF42 318 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF549Q6P9A3 640 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 LANCL3Q6ZV70 420 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ERICH1Q86X53 443 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 STPG4Q8N801 248 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 MFSD9Q8NBP5 474 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 MNS1Q8NEH6 495 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR51G2Q8NGK0 314 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD101Q93033 1021 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SGK3Q96BR1 496 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 C10orf35Q96D05 121 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRRC39Q96DD0 335 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC6A7Q99884 636 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB34Q9BZG1 259 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF160Q9HCG1 818 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 RASD1Q9Y272 281 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 FRMPD4Q14CM0 1322 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-928P-201ENST00000516876 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms