RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TMCO6Q96DC7 493 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SGCZQ96LD1 299 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 COL21A1Q96P44 957 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LMF1Q96S06 567 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ADOQ96SZ5 270 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HPF1Q9NWY4 346 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR83Q9NYM4 423 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 USP22Q9UPT9 525 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT52Q9Y366 437 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX13Q9Y5W8 968 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 M0QX08 132 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA0513O60268 411 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FCMRO60667 390 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CEACAM4O75871 244 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJB5O75953 348 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1D-16P01601 117 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HPGDP15428 266 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KDELR2P33947 212 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SOX3P41225 446 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CYB561P49447 251 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HLCSP50747 726 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP12AP54707 1039 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 POLE2P56282 527 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNJ2P63252 427 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MFAP5Q13361 173 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR68Q15743 365 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK11Q15759 364 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NTRK2Q16620 822 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSWIM7Q19AV6 140 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MTX3Q5HYI7 312 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 BORAQ6PGQ7 559 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LYPD8Q6UX82 237 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 DHFR2Q86XF0 187 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 EID3Q8N140 333 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 BEST3Q8N1M1 668 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM162AQ96A26 154 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LRGUKQ96M69 825 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF145Q96MT1 663 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HHATLQ9HCP6 504 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MKLN1Q9UL63 735 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PCSK5Q92824 1860 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 AGAP5A6NIR3 686 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BNH8 94 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 SCDO00767 359 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOT8O14734 319 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 ARPC2O15144 300 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 MAN1A2O60476 641 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 UGT2B11O75310 529 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6B1O95007 311 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 UTS2O95399 124 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGB2P05107 769 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 THBS1P07996 1170 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 NGFRP08138 427 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP4B1P13584 511 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 NCK1P16333 377 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 IL7RP16871 459 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 TBXA2RP21731 343 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 AQP1P29972 269 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 DCTP40126 519 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXW4P57775 412 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 CXADRP78310 365 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 MS4A2Q01362 244 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-208ENST00000462602 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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