RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435532.7

NEDD4-202, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD4, Length 5,869 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4-202ENST00000435532 GGT1P19440 569 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PKLRP30613 574 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 C5orf46Q6UWT4 87 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 XKR5Q6UX68 686 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SLC7A7Q9UM01 511 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 LRRC42Q9Y546 428 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 G3V2L1 256 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ANXA3P12429 323 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MMP21Q8N119 569 aa14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 FRKP42685 505 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 RBM34P42696 430 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ULK3Q6PHR2 472 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PAQR7Q86WK9 346 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 A0A1W2PPC4 97 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ALOX12BO75342 701 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SLC43A1O75387 559 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 GJB3O75712 270 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PGGT1BP53609 377 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ISPDA4D126 451 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 H3BSH0 61 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 DCTP40126 519 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 FASLGP48023 281 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 C4orf46Q504U0 113 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 NRMQ8IXM6 262 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 CHRDQ9H2X0 955 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 DDAH2O95865 285 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 DPTQ07507 201 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ERV3-1Q14264 604 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 METTL4Q8N3J2 472 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.7□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ZNF749O43361 778 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 LCATP04180 440 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SDC1P18827 310 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 IL10RAQ13651 578 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 LAS2Q8IYD9 372 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 INIPQ9NRY2 104 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MALT1Q9UDY8 824 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 WIF1Q9Y5W5 379 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 H0YAE9 185 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 MBTPS2O43462 519 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 IVDP26440 423 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SOX2P48431 317 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 NKX3-2P78367 333 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 RSU1Q15404 277 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PDXPQ96GD0 296 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 SLC45A3Q96JT2 553 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 PIGQQ9BRB3 760 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 LAMB1P07942 1786 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD4-202ENST00000435532 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms