RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	AAGAB	Q6PD74	315 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	REEP4	Q9H6H4	257 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738		Q9N2J8	555 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	NTM	Q9P121	344 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		16.06	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TTC36	A6NLP5	189 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CLCA1	A8K7I4	914 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738		H0Y3Z8	333 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	HCRTR2	O43614	444 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RCBTB2	O95199	551 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RAF1	P04049	648 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC00032	P0C843	101 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DPP4	P27487	766 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DECR1	Q16698	335 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT2B	Q93097	391 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SFXN2	Q96NB2	322 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TSSK3	Q96PN8	268 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MECR	Q9BV79	373 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DKKL1	Q9UK85	242 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		16.05	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM233	B4DJY2	109 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SCO2	O43819	266 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ATE1	O95260	518 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CHEK2	O96017	543 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SRY	Q05066	204 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FOXF2	Q12947	444 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPB3	Q12988	150 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2A1	Q16548	175 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2M3	Q8NG83	312 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GIMAP5	Q96F15	307 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TM9SF2	Q99805	663 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	DSN1	Q9H410	356 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		16.04	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	NKX2-2	O95096	273 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV1D-16	P01601	117 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PRPS2	P11908	318 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ARRB2	P32121	409 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SORD	Q00796	357 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	KEAP1	Q14145	624 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PPCDC	Q96CD2	204 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	MTERF3	Q96E29	417 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	C18orf12	Q96KH6	178 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SMR3A	Q99954	134 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	FBN3	Q75N90	2809 aa		16.03	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PIP5K1B	O14986	540 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	AKAP10	O43572	662 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SPAG7	O75391	227 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	EPX	P11678	715 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	BCKDHA	P12694	445 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CREB1	P16220	341 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXC12	P31275	282 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GABRA3	P34903	492 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	GPC1	P35052	558 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	SERPINB5	P36952	375 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	ASMT	P46597	345 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN15	P56746	228 aa		16.02	■□□□□ 0.16
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR5	P85299	388 aa		16.02	■□□□□ 0.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms