RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 GAREM2Q75VX8 874 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ASB11Q8WXH4 323 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ARRDC3Q96B67 414 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 UCKL1Q9NWZ5 548 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 IFNA7P01567 189 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MYOGP15173 224 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SELENOWP63302 87 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 OR7A5Q15622 319 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 RAB11BQ15907 218 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MGLLQ99685 303 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 HDAC8Q9BY41 377 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 CBLCQ9ULV8 474 aa23.64■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 STSP08842 583 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 UCHL1P09936 223 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 PSMB5P28074 263 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MAGEA6P43360 314 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MAGEA8P43361 318 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TAP2Q03519 686 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 CDNFQ49AH0 187 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 GTDC1Q4AE62 458 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 RDH8Q9NYR8 311 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 H3BNC9 293 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MAB21L1Q13394 359 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 GPR149Q86SP6 731 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 POGLUT1Q8NBL1 392 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 CD83Q01151 205 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TBC1D20Q96BZ9 403 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF175Q9Y473 711 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SYT7O43581 403 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 FUT1P19526 365 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 DCAF7P61962 342 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 FAM189BP81408 668 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 PKDCCQ504Y2 493 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC22A16Q86VW1 577 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 OR13J1Q8NGT2 312 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 NELFAQ9H3P2 528 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TCHHQ07283 1943 aa23.63■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 H7C417 338 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TGFBR3Q03167 851 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MICAQ29983 383 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 C22orf42Q6IC83 251 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MFSD9Q8NBP5 474 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 CACNG3O60359 315 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 FOXA1P55317 472 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 OR5AK2Q8NH90 309 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ACPTQ9BZG2 426 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 EMC3Q9P0I2 261 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 FBXL3Q9UKT7 428 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM225BP0DP42 221 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 IFNGR1P15260 489 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ACPPP15309 386 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 HOXA9P31269 272 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 STUB1Q9UNE7 303 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ABOP16442 354 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TNFRSF1BP20333 461 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 STK11Q15831 433 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 RTP3Q9BQQ7 232 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 GNMTQ14749 295 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MOGQ16653 247 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 PIGGQ5H8A4 983 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 OR5D16Q8NGK9 328 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TMEM239Q8WW34 195 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ADOQ96SZ5 270 aa23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 RETP07949 1114 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 TMBIM6P55061 237 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MGAT3Q09327 533 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF160Q9HCG1 818 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 VEZF1Q14119 521 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 GK3PQ14409 553 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 SHHQ15465 462 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 XKR5Q6UX68 686 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 FRS2Q8WU20 508 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 CREB3L1Q96BA8 519 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 EVA1AQ9H8M9 152 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 IL20RAQ9UHF4 553 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1-202ENST00000409402 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms