RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ABCG2Q9UNQ0 655 aa20.34■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 H0YC42 278 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 HCRTR2O43614 444 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 IFI6P09912 130 aa20.33■□□□□ 0.85
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KDELR3-202ENST00000409006 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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KDELR3-202ENST00000409006 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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KDELR3-202ENST00000409006 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 GALNT10Q86SR1 603 aa20.33■□□□□ 0.85
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KDELR3-202ENST00000409006 GIMAP5Q96F15 307 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.33■□□□□ 0.85
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KDELR3-202ENST00000409006 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TRAF6Q9Y4K3 522 aa20.33■□□□□ 0.85
KDELR3-202ENST00000409006 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 TBX19O60806 448 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 TNFSF13O75888 250 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 UTS2O95399 124 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 FGF4P08620 206 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 NUDT17P0C025 328 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 EPXP11678 715 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 PRPS2P11908 318 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 CREB1P16220 341 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 GPC1P35052 558 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 PRKAG1P54619 331 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 BCL2A1Q16548 175 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 GRAMD1BQ3KR37 738 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 KIF18BQ86Y91 864 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 FBXO30Q8TB52 745 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 TWIST2Q8WVJ9 160 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 PPCDCQ96CD2 204 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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KDELR3-202ENST00000409006 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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KDELR3-202ENST00000409006 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.32■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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KDELR3-202ENST00000409006 NEFHP12036 1026 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 BCKDHAP12694 445 aa20.31■□□□□ 0.84
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KDELR3-202ENST00000409006 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 SORDQ00796 357 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 RAET1LQ5VY80 246 aa20.31■□□□□ 0.84
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KDELR3-202ENST00000409006 NUP43Q8NFH3 380 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 AGR3Q8TD06 166 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 GPR151Q8TDV0 419 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.31■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 DTNBP1Q96EV8 351 aa20.31■□□□□ 0.84
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KDELR3-202ENST00000409006 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 ANGPTL1O95841 491 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 CHEK2O96017 543 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 CD1EP15812 388 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 CLDN20P56880 219 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 ZAR1Q86SH2 424 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 SLC16A11Q8NCK7 471 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 NUDT8Q8WV74 236 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 FIG4Q92562 907 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 FBXO34Q9NWN3 711 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 ITPR3Q14573 2671 aa20.3■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 A0A1W2PNV4 684 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 A8MXE2 369 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 H3BML4 177 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 KCNH1O95259 989 aa20.29■□□□□ 0.84
KDELR3-202ENST00000409006 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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