RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391012.2

RNU6-1307P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1307, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1307P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1307P-201ENST00000391012 CELF2O95319 508 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TBX18O95935 607 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 FCER2P06734 321 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 OR52Z1P0C646 297 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 CCNA2P20248 432 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SLC26A3P40879 764 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TNFRSF9Q07011 255 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 BIRC2Q13490 618 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 IL11RAQ14626 422 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 KCNJ11Q14654 390 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 GNMTQ14749 295 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 MEF2DQ14814 521 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 UGCGQ16739 394 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 HKDC1Q2TB90 917 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 BTNL8Q6UX41 500 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SPNS3Q6ZMD2 512 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ACP7Q6ZNF0 438 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PRSS41Q7RTY9 318 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 VRK2Q86Y07 508 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 RDH10Q8IZV5 341 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 APCDD1Q8J025 514 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 THEM5Q8N1Q8 247 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 OR52I1Q8NGK6 324 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 RDH11Q8TC12 318 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SPATA18Q8TC71 538 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 EXT2Q93063 718 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 FAM46BQ96A09 425 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TBATAQ96M53 351 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 LRRC3BQ96PB8 259 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 DOK1Q99704 481 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 FERMT1Q9BQL6 677 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ZNF649Q9BS31 505 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 IDI2Q9BXS1 227 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 LHX5Q9H2C1 402 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ZNF222Q9UK12 451 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ERVK-19Q9WJR5 959 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TMEM5Q9Y2B1 443 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 YEATS2Q9ULM3 1422 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SVILO95425 2214 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PFASO15067 1338 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 A0A0B4J203 849 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 A0A1W2PNN7 141 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TRBC2A0A5B9 178 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PGPEP1LA6NFU8 196 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SDR42E2A6NKP2 422 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ZNF850A8MQ14 1090 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 UBXN8O00124 270 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 CHUKO15111 745 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 FAM189A1O60320 539 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SDC3O75056 442 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SRP72O76094 671 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SLC16A8O95907 504 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 IGKV1-39P01597 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 IGKV1D-39P04432 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 P04436 131 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TPBGLP0DKB5 382 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ZNF250P15622 560 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 EFNB2P52799 333 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 KCNK10P57789 538 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ST8SIA6P61647 398 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 HSPA14Q0VDF9 509 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SMARCB1Q12824 385 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PSG5Q15238 335 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SPHARQ15513 63 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SS18Q15532 418 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 OR1C1Q15619 314 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 CYP51A1Q16850 503 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 TEX44Q53QW1 395 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PRR5LQ6MZQ0 368 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 MZT2BQ6NZ67 158 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SPINT4Q6UDR6 99 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 SZRD1Q7Z422 152 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 GPR142Q7Z601 462 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 PARGQ86W56 976 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 ANKRD46Q86W74 232 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1307P-201ENST00000391012 LINC00346Q8IVM7 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms