RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DECR1Q16698 335 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DESI1Q6ICB0 168 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 PACS2Q86VP3 889 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CARM1Q86X55 608 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 OR4D11Q8NGI4 311 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 C7orf34Q96L11 122 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 SAP130Q9H0E3 1048 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 RLIMQ9NVW2 624 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 FLRT3Q9NZU0 649 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.42■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 WWP2O00308 870 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CLOCKO15516 846 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 IL7RP16871 459 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 MAGEA2P43356 314 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 IST1P53990 364 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DCAF7P61962 342 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 PLCXD2Q0VAA5 305 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 FOXC1Q12948 553 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 9.7
LTV1-201ENST00000367576 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 PINK1Q9BXM7 581 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 VNN3Q9NY84 501 aa16.41■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 J3KTA2 159 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 GNGT2O14610 69 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 REM1O75628 298 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 UGT2B17O75795 530 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 SOX30O94993 753 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 SPINK2P20155 84 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DCTP40126 519 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 ST13P50502 369 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 SSPNQ14714 243 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 GRAMD1BQ3KR37 738 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DEF8Q6ZN54 512 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 VASH2Q86V25 355 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 RASSF5Q8WWW0 418 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 ARSGQ96EG1 525 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 G6PC3Q9BUM1 346 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 GPR87Q9BY21 358 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 POLE3Q9NRF9 147 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 SLC13A4Q9UKG4 626 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CHST2Q9Y4C5 530 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 PCSK5Q92824 1860 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 IFNW1P05000 195 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DBIP07108 87 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CD82P27701 267 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 NDUFAF7Q7L592 441 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 MRGPREQ86SM8 312 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 OMA1Q96E52 524 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 ADOQ96SZ5 270 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 CIB1Q99828 191 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 NDUFAF4Q9P032 175 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 KLK13Q9UKR3 277 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 IFT52Q9Y366 437 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.4■□□□□ 0.22
LTV1-201ENST00000367576 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ZFAND5O76080 213 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 IL33O95760 270 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 IL12BP29460 328 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 PRKAR1BP31321 381 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 KRT20P35900 424 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 HOXC5Q00444 222 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CAMK2BQ13554 666 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 ATP1A4Q13733 1029 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 EXT1Q16394 746 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 LIN52Q52LA3 116 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 SLC34A3Q8N130 599 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 OR4C3Q8NH37 302 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 NTN4Q9HB63 628 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 CTPS2Q9NRF8 586 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 THSD1Q9NS62 852 aa16.39■□□□□ 0.21
LTV1-201ENST00000367576 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms