RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ARMC4Q5T2S8 1044 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2G6Q5TZ20 316 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 LAPTM4BQ86VI4 370 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB43Q86YS6 212 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 NR4A3Q92570 626 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DIO2Q92813 273 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ELP4Q96EB1 424 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RNFT2Q96EX2 444 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF681Q96N22 645 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 IRGMA1A4Y4 181 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 UBXN7O94888 489 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MPIP34949 423 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TPBGQ13641 420 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 CCINQ13939 588 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAM2Q15035 370 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PLK5Q496M5 336 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 C22orf42Q6IC83 251 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 VRK2Q86Y07 508 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 KCT2Q8NC54 265 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 NUP43Q8NFH3 380 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC9A6Q92581 669 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM203Q969S6 136 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ST6GAL2Q96JF0 529 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ISYNA1Q9NPH2 558 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA4GQ9NTN9 838 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM170BA6NMN3 283 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 FRS3O43559 492 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 NR2F6P10588 404 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PVRP15151 417 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MAOBP27338 520 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 IFNGR2P38484 337 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MC3RP41968 323 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TGM3Q08188 693 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MINDY4Q4G0A6 757 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR174Q9BXC1 333 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RMI1Q9H9A7 625 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR52Q9Y2T5 361 aa17.54■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 APOL3O95236 402 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ALPPP05187 535 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN19P0C672 248 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC2LP0C7M8 214 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DRD1P21728 446 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 OMPP47874 163 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MTNR1AP48039 350 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKK1Q8NFD2 765 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 OR9A2Q8NGT5 310 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MIXL1Q9H2W2 232 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPT1Q9Y234 373 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQ09 198 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SNTNA6NMZ2 147 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SEC14L5O43304 696 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 IDH3BO43837 385 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJB6O75190 326 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DDOSTP39656 456 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP1CAP62136 330 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP4K2Q12851 820 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG11Q2TAA5 492 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GJD3Q8N144 294 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MFSD9Q8NBP5 474 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GATAD2BQ8WXI9 593 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 MED18Q9BUE0 208 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCB9Q9NP78 766 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 EQTNQ9NQ60 294 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TIGARQ9NQ88 270 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 CNIH4Q9P003 139 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM172BPA6NC97 362 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNJ13O60928 360 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 NTN1O95631 604 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS25P62851 125 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF425Q6IV72 752 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GIMAP5Q96F15 307 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC38A2Q96QD8 506 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 YIPF2Q9BWQ6 316 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD19PQ9H560 264 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 GSAPA4D1B5 854 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA4FO95754 770 aa17.52■□□□□ 0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms