RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FBXO30Q8TB52 745 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PIK3R3Q92569 461 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 JADE3Q92613 823 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 WDYHV1Q96HA8 205 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NCKAP5O14513 1909 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM120BA0PK00 339 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 H0Y3Z8 333 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TOXO94900 526 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 UTS2O95399 124 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 IL2RAP01589 272 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PRF1P14222 555 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MSX1P28360 303 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DCST1Q5T197 706 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 COX18Q8N8Q8 333 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GIMAP5Q96F15 307 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TRIB1Q96RU8 372 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SORT1Q99523 831 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DSN1Q9H410 356 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CD8B2A6NJW9 211 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DVL2O14641 736 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CFLARO15519 480 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SASH3O75995 380 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 KRT16P08779 473 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ACP2P11117 423 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CPN1P15169 458 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SSTR2P30874 369 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 LCN1P31025 176 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TIMP3P35625 211 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MAP3K8P41279 467 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CLDN8P56748 225 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 C21orf58P58505 322 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TFF3Q07654 80 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 BST1Q10588 318 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FADS6Q8N9I5 356 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SLC16A11Q8NCK7 471 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MOAP1Q96BY2 351 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 COQ8BQ96D53 544 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC46Q96FV0 321 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DUSP26Q9BV47 211 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CALHM2Q9HA72 323 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HAO1Q9UJM8 370 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SOX30O94993 753 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 C6orf47O95873 294 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CHMP24386 653 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CCT3P49368 545 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SLC18A1P54219 525 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GFRA1P56159 465 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 TP53BP2Q13625 1128 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 DUSP5Q16690 384 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PGS1Q32NB8 556 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MARCH3Q86UD3 253 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC34Q8IZ02 419 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 ACBD4Q8NC06 268 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 OR2M3Q8NG83 312 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 SFXN5Q8TD22 340 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-201ENST00000344376 MGARPQ8TDB4 240 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms