RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 P3H2Q8IVL5 708 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ZBTB44Q8NCP5 570 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SLC7A13Q8TCU3 470 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 CTHRC1Q96CG8 243 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 H0YJX3 145 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PDE9AO76083 593 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 FBLP22087 321 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 LSAMPQ13449 338 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00469Q8N7U9 141 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PIK3C3Q8NEB9 887 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 RHBDD1Q8TEB9 315 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 MOAP1Q96BY2 351 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ITPAQ9BY32 194 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 FLRT3Q9NZU0 649 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 A4GNTQ9UNA3 340 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ORC6Q9Y5N6 252 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 URB1O60287 2271 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 A0A0G2JPF8 293 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 BCKDKO14874 412 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMDEC1O15204 470 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 OR10H3O60404 316 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 RYKP34925 604 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 KCNC4Q03721 635 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 CD47Q08722 323 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 MICAQ29983 383 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SLC23A3Q6PIS1 610 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF836Q6ZNA1 936 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF595Q8IYB9 648 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 BBS10Q8TAM1 723 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 IL20RAQ9UHF4 553 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 FBXO4Q9UKT5 387 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 MYRFQ9Y2G1 1151 aa10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SDK2Q58EX2 2172 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 H3BNH8 94 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 GNB5O14775 395 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SCRG1O75711 98 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 KCNK2O95069 426 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 TNFAIP8O95379 198 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 LGI1O95970 557 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF28P17035 718 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 RHCEP18577 417 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ITIH1P19827 911 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 RPP38P78345 283 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 NR1D2Q14995 579 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PDZK1Q5T2W1 519 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 GARNL3Q5VVW2 1013 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 USP51Q70EK9 711 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SCAIQ8N9R8 606 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 TSPAN14Q8NG11 270 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 GPA33Q99795 319 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 OR10A5Q9H207 317 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PIGUQ9H490 435 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 THSD1Q9NS62 852 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SEMA4GQ9NTN9 838 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 C3orf18Q9UK00 162 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GX78 115 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 MAN1A2O60476 641 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ADAM11O75078 769 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 UGT2B17O75795 530 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 DNAJB5O75953 348 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 CER1O95813 267 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 CLPTM1O96005 669 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 TFAP2AP05549 437 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ITGA2P17301 1181 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 MAP4K2Q12851 820 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 LAIR2Q6ISS4 152 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.18□□□□□ -0.78
GGPS1-201ENST00000282841 PODNL1Q6PEZ8 512 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms