RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 ARAP2Q8WZ64 1704 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LYRM1O43325 122 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DUX1O43812 170 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DEFA5Q01523 94 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CACNG3O60359 315 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FMO6PO60774 539 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GPX2P18283 190 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP24386 653 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SLC6A11P48066 632 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LEG1Q6P5S2 330 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CNIH2Q6PI25 160 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF283Q8N7M2 679 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SFXN5Q8TD22 340 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RABL2BQ9UNT1 228 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TP53I11O14683 189 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ALDH3B2P48448 385 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF91Q05481 1191 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DESI1Q6ICB0 168 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 VRK3Q8IV63 474 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 J3KTA2 159 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 P2RY2P41231 377 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HOXC5Q00444 222 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 USP53Q70EK8 1073 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 STX12Q86Y82 276 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TANKQ92844 425 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB126Q9BYW3 111 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa16.6■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TOXO94900 526 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ART1P52961 327 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SERTAD2Q14140 314 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 KCTD9Q7L273 389 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 A0A1W2PPL8 197 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SLC16A6O15403 523 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 IRF4Q15306 451 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SLC22A10Q63ZE4 541 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ASB15Q8WXK1 588 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CD93Q9NPY3 652 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 F5P12259 2224 aa16.59■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PROS1P07225 676 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 AHRP35869 848 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CLDN2P57739 230 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CLRN1P58418 232 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FXYD6P3P58550 94 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NSDHLQ15738 373 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 MSLNLQ96KJ4 702 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ASIC5Q9NY37 505 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CCL26Q9Y258 94 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 MAN2B1O00754 1011 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FURINP09958 794 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CR2P20023 1033 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ARRB2P32121 409 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 AFMIDQ63HM1 303 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 EGFL6Q8IUX8 553 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CDS1Q92903 461 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HRASLS5Q96KN8 279 aa16.58■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PHYHO14832 338 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 SLCO2B1O94956 709 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PLGP00747 810 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 GKN3PP0CG01 181 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 PRPS1P60891 318 aa16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms