RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PMEPA1Q969W9 287 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF31Q96EP0 1072 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM80Q96HE8 168 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 EPHA6Q9UF33 1036 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 SNX8Q9Y5X2 465 aa24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 ETHE1O95571 254 aa24.6■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 WDR34Q96EX3 536 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 OSMP13725 252 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PVRP15151 417 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFB11Q9NX14 153 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCC3Q9ULS5 477 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 FURINP09958 794 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF1BP20333 461 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC12Q96GR4 267 aa24.59■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 POMT2Q9UKY4 750 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SSR3Q9UNL2 185 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CMAHPQ9Y471 501 aa24.58■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 SEC14L5O43304 696 aa24.57■■□□□ 1.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC16A8O95907 504 aa24.57■■□□□ 1.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN22Q8N7P3 220 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9A1PQ8NGU1 263 aa24.57■■□□□ 1.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 ST6GAL2Q96JF0 529 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DPYSL5Q9BPU6 564 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 STRADBQ9C0K7 418 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TWSG1Q9GZX9 223 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLA2Q9H6Q3 261 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PISDQ9UG56 409 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL20Q9Y2M5 609 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD34BA5PLL1 514 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PLD2O14939 933 aa24.57■■□□□ 1.52
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