RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 A0A286YDP4 300 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mamdc4A2AJA7 1228 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Itga10E9Q6R1 1167 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prr22F6TNE3 422 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm7535F7CXE4 302 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Matn3O35701 481 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2-T23P06339 357 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tead1P30051 426 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnj12P52187 427 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HpcaP84075 193 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thoc6Q5U4D9 341 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snta1Q61234 503 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serinc5Q8BHJ6 461 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dock8Q8C147 2100 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc25a36Q922G0 311 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Timm50Q9D880 353 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q9DAR0 182 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wwp2Q9DBH0 870 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lgi1Q9JIA1 557 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exo1Q9QZ11 837 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ChmlQ9QZD5 621 aa18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4932443I19RikA0A286YE38 169 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tas2r122D3YU55 309 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm8237E9Q257 205 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 5430401F13RikE9Q328 175 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr741L7N1Y5 311 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxc5P32043 222 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Defa-rs12P50716 91 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acod1P54987 488 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 B3gnt4Q1RLK6 350 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Teddm2Q208S0 260 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm10330Q8BKS1 112 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdc73Q8JZM7 531 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Casc3Q8K3W3 698 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr5bQ9D7H2 328 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PolmQ9JIW4 496 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MeltfQ9R0R1 738 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp300A2AE21 645 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gpr50O88495 591 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Galr3O88853 370 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mtnd1P03888 318 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MagP20917 626 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TtlP38585 377 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Syt4P40749 425 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Taf1aP97357 453 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Agbl4Q09LZ8 540 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnk9Q3LS21 402 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc30a10Q3UVU3 470 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cpt1cQ8BGD5 798 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pex26Q8BGI5 305 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxl14Q8BID8 400 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cldn17Q8BXA6 224 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf322Q8BZ89 410 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smco1Q8CEZ1 214 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc35c2Q8VCX2 364 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc5a2Q923I7 670 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AmnQ99JB7 458 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Naalad2Q9CZR2 740 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GabarapQ9DCD6 117 aa18.5■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp937A2ANU7 503 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1206A2ATJ9 307 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp1b1P14094 304 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thbs1P35441 1170 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr744Q7TRM0 323 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glt28d2Q8BML3 165 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ston1Q8CDJ8 730 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snrnp27Q8K194 155 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alkbh3Q8K1E6 286 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lyrm4Q8K215 91 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plac9Q8K262 108 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rpusd1Q8VCZ8 306 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dusp7Q91Z46 422 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dctn2Q99KJ8 402 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hint3Q9CPS6 165 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ergic3Q9CQE7 383 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptges3lQ9D9A7 131 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Jph1Q9ET80 660 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr12Q9JJA4 423 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxw5Q9QXW2 573 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pmm2Q9Z2M7 242 aa18.49■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl4a1O35256 227 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mpzl2O70255 215 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P03976 113 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TstP52196 297 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Erp29P57759 262 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smad4P97471 551 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 FhP97807 507 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lemd1Q14C37 129 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mmp25Q3U435 615 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MybphlQ5FW53 355 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Morn4Q6PGF2 146 aa18.48■□□□□ 0.55
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dsg4Q7TMD7 1041 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.1 ms