RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 PRKAB1Q9Y478 270 aa16.58■□□□□ 0.25
GLIS1-202ENST00000628545 DMRT1Q9Y5R6 373 aa16.58■□□□□ 0.25
GLIS1-202ENST00000628545 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TRBC2A0A5B9 178 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ADAMTS4O75173 837 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ANKRD34CP0C6C1 535 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 EPORP19235 508 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PTGER3P43115 390 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CCDC157Q569K6 752 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 HACD4Q5VWC8 232 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 OXR1Q8N573 874 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CA10Q9NS85 328 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TAS2R3Q9NYW6 316 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MARK1Q9P0L2 795 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa16.58■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 STMND1H3BQB6 276 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 FFAR1O14842 300 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MID1O15344 667 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ARPC5O15511 151 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GKP32189 559 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PON3Q15166 354 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GCNT6Q5T4J0 391 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMUB2Q71RG4 321 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SSX9Q7RTT3 188 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LHFPL3Q86UP9 236 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RNFT2Q96EX2 444 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CIPCQ9C0C6 399 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ARL6Q9H0F7 186 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GPATCH2Q9NW75 528 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TRBC1P01850 177 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IFNW1P05000 195 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LIMS3P0CW19 117 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LIMS4P0CW20 117 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PPP3CBP16298 524 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RGS4P49798 205 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MELKQ14680 651 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GUCA2BQ16661 112 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 P2RY12Q9H244 342 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CA5BQ9Y2D0 317 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IRAK3Q9Y616 596 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.57■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 AGAP14A8MT82 685 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RHOQP17081 205 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRPH2P23942 346 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TSPAN7P41732 249 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 DGCR2P98153 550 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ELP2Q6IA86 826 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PGAP1Q75T13 922 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SVBPQ8N300 66 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MS4A4EQ96PG1 132 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NTMQ9P121 344 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CBLCQ9ULV8 474 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 FZD7O75084 574 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SERPINA3P01011 423 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 WNT1P04628 370 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 THP07101 528 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFB7P17568 137 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NPR2P20594 1047 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ACVRL1P37023 503 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LIM2P55344 173 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CCL23P55773 120 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SPCS3P61009 180 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 HBMQ6B0K9 141 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PIGKQ92643 395 aa16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms