RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCNTO95613 3336 aa9□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1W2PP55 124 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1W2PS29 197 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 MEIOCA2RUB1 952 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM172BPA6NC97 362 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 J3QRE1 110 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHST10O43529 356 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 STATHP02808 62 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 THY1P04216 161 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ASGR2P07307 311 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 THBS1P07996 1170 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 IFI6P09912 130 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 C8orf89P0DMQ9 161 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 GNSP15586 552 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTGER1P34995 402 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CDH11P55287 796 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 BDH1Q02338 343 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 MXD1Q05195 221 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 MAP4K2Q12851 820 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 SGCGQ13326 291 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 VN1R4Q7Z5H5 301 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM145Q8NBT3 493 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZG16BQ96DA0 208 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC41A3Q96GZ6 507 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TPK1Q9H3S4 243 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 FN3KQ9H479 309 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CNIH4Q9P003 139 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 KLF15Q9UIH9 416 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PHF11Q9UIL8 331 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CBLCQ9ULV8 474 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 POLHQ9Y253 713 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.99□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa8.99□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 DOCK9Q9BZ29 2069 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1W2PQU0 124 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 B4DXG7 233 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLA2G10O15496 165 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 FRS3O43559 492 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 LATO43561 262 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 IDH3BO43837 385 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMCC2O75069 709 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYPD3O95274 346 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 LALBAP00709 142 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 HLA-DPB1P04440 258 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CFL1P23528 166 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 HLA-DMAP28067 261 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 NDUFS1P28331 727 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 CD79BP40259 229 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 WASP42768 502 aa8.98□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 TNFRSF4P43489 277 aa8.98□□□□□ -0.97
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