RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 UCK1Q9HA47 277 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.16□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 HIST1H2ADP20671 130 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM27E3Q08E93 113 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 ERVK-11Q9UQG0 969 aa7.15□□□□□ -1.26
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ATG4D-210ENST00000588972 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.15□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 OR6C74A6NCV1 312 aa7.14□□□□□ -1.27
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ATG4D-210ENST00000588972 SLCO2B1O94956 709 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 KRT4P19013 534 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CD151P48509 253 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 GPR143P51810 404 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CDKN2DP55273 166 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.273e-8■■□□□ 13.7
ATG4D-210ENST00000588972 SPATS1Q496A3 300 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 IRGCQ6NXR0 463 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TRILQ7L0X0 811 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ATG4D-210ENST00000588972 CAMKMTQ7Z624 323 aa7.14□□□□□ -1.27
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