RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WDR41Q9HAD4 459 aa8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLLPQ9Y342 182 aa8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB4Q9Y574 426 aa8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.99□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PR80 420 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAGEB16A2A368 324 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLPP1O14494 284 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFSF11O14788 317 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOX3O15254 700 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMPRSS11DO60235 418 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AHSGP02765 367 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IL12BP29460 328 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT20P35900 424 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA7P48741 367 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHN2P52757 468 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GAS1P54826 345 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDH15P55291 814 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IRF8Q02556 426 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHIT1Q13231 466 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCGB2A2Q13296 93 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBLN7Q53RD9 439 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 29.6
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMNTD2Q8IXW0 634 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FADS6Q8N9I5 356 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF540Q8NDQ6 660 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52N5Q8NH56 324 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD3Q8WU67 409 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 JMJD8Q96S16 334 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INPP5KQ9BT40 448 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESM1Q9NQ30 184 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLRX2Q9NS18 164 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MED29Q9NX70 200 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP22Q9UPT9 525 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OARD1Q9Y530 152 aa8.98□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 M0R1B8 84 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAPBPO15533 448 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC175P0C221 793 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHRS4L1P0CG22 281 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPSB2P20231 275 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPHA1P21709 976 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRD5P21918 477 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCMT1P22061 227 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD40P25942 277 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARFIP2P53365 341 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CORO7P57737 925 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHC1P78364 1004 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POU4F1Q01851 419 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP2Q05923 314 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LAPTM5Q13571 262 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF460Q14592 562 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLC1Q15049 377 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIP10Q15642 601 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPSAB1Q15661 275 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52E8Q6IFG1 317 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF544Q6NX49 715 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR4K14Q8NGD5 310 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GBP4Q96PP9 640 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS50Q9UI38 385 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VDAC3Q9Y277 283 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFL2Q9Y281 166 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VWA7Q9Y334 891 aa8.97□□□□□ -0.97
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCT8L1PA6NM43 557 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9JVG2 144 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LILRA1O75019 489 aa8.96□□□□□ -0.98
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPM3P06753 285 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms