RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 GALNT2Q10471 571 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CDH17Q12864 832 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MERTKQ12866 999 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TRAF2Q12933 501 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TSPAN31Q12999 210 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PEX6Q13608 980 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PDK2Q15119 407 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LTB4RQ15722 352 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CEBPEQ15744 281 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 STXBP2Q15833 593 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM44Q2T9K0 475 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 NADK2Q4G0N4 442 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 IQCCQ4KMZ1 466 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 AGBL2Q5U5Z8 902 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC38Q5VT99 294 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LIPNQ5VXI9 398 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM268Q5VZI3 342 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 OR5M10Q6IEU7 315 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TTI2Q6NXR4 508 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TTC27Q6P3X3 843 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 RFWD3Q6PCD5 774 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 KLHL17Q6TDP4 642 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MON1BQ7L1V2 547 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PAGE2Q7Z2X7 111 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 SERPINA11Q86U17 422 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 FAM228AQ86W67 206 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 KIRREL3Q8IZU9 778 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 WDTC1Q8N5D0 677 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TRAM1L1Q8N609 369 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TEX45Q8NA69 505 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LEMD2Q8NC56 503 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 BPIFCQ8NFQ6 507 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 OR2L3Q8NG85 312 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 NDNFQ8TB73 568 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJB3Q8WWF6 145 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 DNASE1L2Q92874 299 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 FGF13Q92913 245 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MYDGFQ969H8 173 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MARC2Q969Z3 335 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 NXPE2Q96DL1 559 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MED8Q96G25 268 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LURAP1Q96LR2 239 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 C12orf66Q96MD2 445 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CASD1Q96PB1 797 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CSPG4P5Q96PW8 444 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 FRG2BQ96QU4 278 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TAAR6Q96RI8 345 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TAAR1Q96RJ0 339 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PKP2Q99959 881 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 REEP2Q9BRK0 252 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 C16orf70Q9BSU1 422 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TPPP3Q9BW30 176 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 IFT27Q9BW83 186 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CACNG6Q9BXT2 260 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 GON7Q9BXV9 100 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TOLLIPQ9H0E2 274 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 VCX2Q9H322 139 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MINDY3Q9H8M7 445 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ECT2Q9H8V3 914 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 FOLH1BQ9HBA9 442 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 NOD2Q9HC29 1040 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MMP25Q9NPA2 562 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CHST11Q9NPF2 352 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 PNPLA3Q9NST1 481 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TREX1Q9NSU2 369 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 ETNK2Q9NVF9 386 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM161AQ9NX61 479 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 TRPC4Q9UBN4 977 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 UPB1Q9UBR1 384 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 SLC24A2Q9UI40 661 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 KCNG2Q9UJ96 466 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 NUP50Q9UKX7 468 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 IFT52Q9Y366 437 aa2.79□□□□□ -1.96
ATXN3-211ENST00000511362 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms