RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506464.5

ABCC3-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 3, human

TSL 4

Gene ABCC3, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC3-208	ENST00000506464	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	FBN2	P35556	2912 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SYT5	O00445	386 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	TSPAN2	O60636	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	IL18BP	O95998	194 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CYP4B1	P13584	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	BMP7	P18075	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SRD5A2	P31213	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OPRM1	P35372	400 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PTGDS	P41222	190 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ASCL1	P50553	236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	RNF138	Q8WVD3	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	KAT2A	Q92830	837 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	PDZD2	O15018	2839 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ABCC3-208	ENST00000506464	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TBX19	O60806	448 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PEX11A	O75192	247 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GOSR1	O95249	250 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	BCKDHA	P12694	445 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CHM	P24386	653 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MYBPH	Q13203	477 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PDE7A	Q13946	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	EIPR1	Q53HC9	387 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	IFNE	Q86WN2	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR2L13	Q8N349	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR7G2	Q8NG99	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TSSK3	Q96PN8	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	ADO	Q96SZ5	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	TM9SF2	Q99805	663 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464		Q9N2J8	555 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	THAP1	Q9NVV9	213 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	FREM3	P0C091	2139 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	LINC01387	J3KSC0	135 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	PSMG1	O95456	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	BMP5	P22003	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CTSS	P25774	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	CORO7	P57737	925 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	OCRL	Q01968	901 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	BCL2A1	Q16548	175 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	DECR1	Q16698	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ABCC3-208	ENST00000506464	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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