RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 HRKO00198 91 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TP73O15350 636 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CT62P0C5K7 136 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 HK1P19367 917 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CNTFP26441 200 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 AGTR1P30556 359 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 XKP51811 444 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLC12A2P55011 1212 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FAM27E3Q08E93 113 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 EFNB3Q15768 340 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 STK11Q15831 433 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MSS51Q4VC12 460 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SPIN4Q56A73 249 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR2L13Q8N349 312 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ARL8AQ96BM9 186 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CENPEQ02224 2701 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM89A2RUT3 159 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV4-39P01824 125 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RPS17P08708 135 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TACSTD2P09758 323 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CPT2P23786 658 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 STX2P32856 288 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KCNJ1P48048 391 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 HSPA7P48741 367 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 MAP2K6P52564 334 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZSR9 355 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SHISA9B4DS77 424 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 G3V3Y1 287 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CD8AP01732 235 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ENO1P06733 434 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 RBP1P09455 135 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SAT1P21673 171 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SSTR4P31391 388 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PPOXP50336 477 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLC16A1P53985 500 aa6.88□□□□□ -1.31
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PDE4D-210ENST00000503258 PRR31Q5SQ13 230 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CPTPQ5TA50 214 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FRG2Q64ET8 278 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 VWA1Q6PCB0 445 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 Q6ZT83 130 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SPC24Q8NBT2 197 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CCT6BQ92526 530 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PERPQ96FX8 193 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 GPR78Q96P69 363 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 FRG2BQ96QU4 278 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PSD2Q9BQI7 771 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 CD274Q9NZQ7 290 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 NKX2-2O95096 273 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL2O95198 593 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SYNGR4O95473 234 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PTAFRP25105 342 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KRT20P35900 424 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2H2Q13888 395 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 SLMAPQ14BN4 828 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PGGHGQ32M88 737 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 ADAM19Q9H013 955 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-210ENST00000503258 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.88□□□□□ -1.31
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