RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497715.1

CUL3-212, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 2,400 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-212ENST00000497715 IFNEQ86WN2 208 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ANGPTL5Q86XS5 388 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TNS4Q8IZW8 715 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TMEM156Q8N614 296 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GRHL3Q8TE85 626 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 DIO2Q92813 273 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 FKBP10Q96AY3 582 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 CERS2Q96G23 380 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SUSD3Q96L08 255 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 FCRL1Q96LA6 429 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ZNF607Q96SK3 696 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 FMO2Q99518 471 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TBX5Q99593 518 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 NPAS2Q99743 824 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SLC6A13Q9NSD5 602 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 FKBPLQ9UIM3 349 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 HSF4Q9ULV5 492 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 NEU3Q9UQ49 428 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SPEF2Q9C093 1822 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 A0A1B0GV72 72 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 A6NIZ1 184 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 M0R143 59 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 RGS14O43566 566 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 HCN1O60741 890 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 CILPO75339 1184 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SH3BGRLO75368 114 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GLCEO94923 617 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ADAP00813 363 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GABRA1P14867 456 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SELEP16581 610 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 CD82P27701 267 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SLC6A6P31641 620 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ETV4P43268 484 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 PNLIPRP1P54315 467 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 RAG2P55895 527 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 DEFA1P59665 94 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 DEFA3P59666 94 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 BTG1P62324 171 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SPIBQ01892 262 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 RING1Q06587 406 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 PTP4A2Q12974 167 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SMIM21Q3B7S5 101 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 AGBL4Q5VU57 503 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 MED27Q6P2C8 311 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GRINAQ7Z429 371 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TMEM135Q86UB9 458 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ZNF276Q8N554 614 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ZNF283Q8N7M2 679 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ZNF614Q8N883 585 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 RNF152Q8N8N0 203 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GDPD1Q8N9F7 314 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 FBXL13Q8NEE6 735 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 OR51S1Q8NGJ8 323 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 NTNG2Q96CW9 530 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ZNF778Q96MU6 729 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 OR5B2Q96R09 309 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 SGPP1Q9BX95 441 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 GPR83Q9NYM4 423 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 POMPQ9Y244 141 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TOPBP1Q92547 1522 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 UGGT1Q9NYU2 1555 aa4.75□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 TMEM72A0PK05 275 aa4.74□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 IFITM10A6NMD0 228 aa4.74□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 H3BN98 237 aa4.74□□□□□ -1.65
CUL3-212ENST00000497715 AIPO00170 330 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms