RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 OR5H15A6NDH6 313 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FAM220BPB1ANY3 271 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CEACAM4O75871 244 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 KCNK2O95069 426 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SNX4O95219 450 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 BCHEP06276 602 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 DBIP07108 87 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CT45A8P0DMV1 189 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CT45A9P0DMV2 189 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 BMP2P12643 396 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ETFAP13804 333 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 IL7RP16871 459 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 IFNA8P32881 189 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 GCKP35557 465 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PGM1P36871 562 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC7A2P52569 658 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 EFNA3P52797 238 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 POLE2P56282 527 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CDK6Q00534 326 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LIPEQ05469 1076 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SCARB2Q14108 478 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 NNATQ16517 81 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN26Q16670 478 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 DUSP5Q16690 384 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 EIPR1Q53HC9 387 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CT45A2Q5DJT8 189 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf89Q6UWU4 347 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 IL20RBQ6UXL0 311 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PACS2Q86VP3 889 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 IFNEQ86WN2 208 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 BCORP1Q8N888 145 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FDCSPQ8NFU4 85 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 OR5D16Q8NGK9 328 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO30Q8TB52 745 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 TMBIM1Q969X1 311 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 GIMAP5Q96F15 307 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC35A4Q96G79 324 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 C16orf58Q96GQ5 468 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RNF145Q96MT1 663 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CDRT15Q96T59 188 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 THTPAQ9BU02 230 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ANKRA2Q9H9E1 313 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 KLRF1Q9NZS2 232 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LRFN1Q9P244 771 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ABCG2Q9UNQ0 655 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 EPG5Q9HCE0 2579 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 HMGN4O00479 90 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO45P0C2W1 286 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ACP2P11117 423 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ETS2P15036 469 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ME2P23368 584 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PTPN6P29350 595 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 MASP1P48740 699 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ATP12AP54707 1039 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CORO7P57737 925 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A3Q00325 362 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 Q0VFX4 171 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 KCNAB2Q13303 367 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 GPR68Q15743 365 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 NTRK2Q16620 822 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 TBR1Q16650 682 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 VMACQ2NL98 169 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 GTDC1Q4AE62 458 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 LIN52Q52LA3 116 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RABL3Q5HYI8 236 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CMIPQ8IY22 773 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 SHISA5Q8N114 240 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 BEST3Q8N1M1 668 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC4FQ8N1N0 589 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF614Q8N883 585 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 PIK3R3Q92569 461 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-210ENST00000486889 RAB8BQ92930 207 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms