RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TM2D1Q9BX74 207 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ELOVL4Q9GZR5 314 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RAB17Q9H0T7 212 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 YAE1D1Q9NRH1 226 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ABCC4O15439 1325 aa3.1□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 H3BTX0 84 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 CASKO14936 926 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PPIHO43447 177 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 LY6G6DO95868 133 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GSTT2P0CG29 244 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GSTT2BP0CG30 244 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 PRKAR2BP31323 418 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GPR65Q8IYL9 337 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 FAM71CQ8NEG0 241 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ADIPOR1Q96A54 375 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 ACTR8Q9H981 624 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 VNN3Q9NY84 501 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 MOKQ9UQ07 419 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 GRIN2DO15399 1336 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM39-211ENST00000426951 A8MU10 97 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 E9PMD0 336 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SGK494L7N484 410 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RASGRF2O14827 1237 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 H2AFZP0C0S5 128 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 IGHV1-2P23083 117 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB25P24278 435 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PRKCEQ02156 737 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SPP2Q13103 211 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TFDP1Q14186 410 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CEBPEQ15744 281 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CAMK4Q16566 473 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RAET1GQ6H3X3 334 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CNSTQ6PJW8 725 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 LPCAT2Q7L5N7 544 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 VPS36Q86VN1 386 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ELMO2Q96JJ3 720 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TSSK1BQ9BXA7 367 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KRT23Q9C075 422 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DPM3Q9P2X0 92 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 METP08581 1390 aa3.08□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RNF222A6NCQ9 220 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PDXKO00764 312 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TNFSF11O14788 317 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TM9SF1O15321 606 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 JCHAINP01591 159 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RRASP10301 218 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 FUT1P19526 365 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 IL1RL1Q01638 556 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KIAA0040Q15053 153 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PARP10Q53GL7 1025 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF677Q86XU0 584 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 C9orf40Q8IXQ3 194 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 C14orf79Q96F83 325 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 C1orf21Q9H246 121 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms