RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423855.6

RNPC3-201, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPC3, Length 1,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-201ENST00000423855 CLIC3O95833 236 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 CLPTM1O96005 669 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 IFNA16P05015 189 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 IFI6P09912 130 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ITGAMP11215 1152 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TCN2P20062 427 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PRKACGP22612 351 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 SSTR4P31391 388 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 GALNSP34059 522 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 LIMS1P48059 325 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 DAPP51397 102 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 HMGA2P52926 109 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 EMP2P54851 167 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 MAP4K2Q12851 820 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 KCNAB2Q13303 367 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 RTP5Q14D33 572 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 RFX4Q33E94 735 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 IFI44LQ53G44 452 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TTC23Q5W5X9 447 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 LAIR2Q6ISS4 152 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 KRT80Q6KB66 452 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 REEP3Q6NUK4 255 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TMEM205Q6UW68 189 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF605Q86T29 641 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 DTX1Q86Y01 620 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 SLC38A5Q8WUX1 472 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 CYGBQ8WWM9 190 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 C8orf44Q96CB5 159 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 MS4A4EQ96PG1 132 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 EPYCQ99645 322 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 EQTNQ9NQ60 294 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.64□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 A8MUA0 341 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 MFN2O95140 757 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PGM3O95394 542 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 DDAH2O95865 285 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 IGKV3-11P04433 115 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 CYC1P08574 325 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 SPINK2P20155 84 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 AQP1P29972 269 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PIGAP37287 484 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PRIM2P49643 509 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PGDP52209 483 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PRKAG1P54619 331 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 NR1H2P55055 460 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PRR5P85299 388 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 FUT7Q11130 342 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 FOXC1Q12948 553 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 BIKQ13323 160 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 BORAQ6PGQ7 559 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF615Q8N8J6 731 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 NUP43Q8NFH3 380 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 OR5D16Q8NGK9 328 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 NKD1Q969G9 470 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 MOAP1Q96BY2 351 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 SLC35G5Q96KT7 338 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 MUS81Q96NY9 551 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 PSD2Q9BQI7 771 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 TCFL5Q9UL49 500 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 ANGPT4Q9Y264 503 aa8.63□□□□□ -1.03
RNPC3-201ENST00000423855 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms