RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 COL12A1Q99715 3063 aa24.64■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PRRG2O14669 202 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CFLARO15519 480 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 IL33O95760 270 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 MAN2A2P49641 1150 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 GAS1P54826 345 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SNTA1Q13424 505 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 DECR1Q16698 335 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 NXNQ6DKJ4 435 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PAOXQ6QHF9 649 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ZAR1Q86SH2 424 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD46Q86W74 232 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR5M9Q8NGP3 310 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 TESCQ96BS2 214 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SERHLQ9NQF3 203 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PNPLA3Q9NST1 481 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 QPCTLQ9NXS2 382 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 WIF1Q9Y5W5 379 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 USH1CQ9Y6N9 552 aa24.63■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 AQP7O14520 342 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SCO2O43819 266 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SOAT1P35610 550 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 KIR3DL1P43629 444 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CCT3P49368 545 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PER3P56645 1201 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PRR5P85299 388 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 TP53BP2Q13625 1128 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SPDYE7PQ495Y7 208 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR5M10Q6IEU7 315 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SPATA19Q7Z5L4 167 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 NATD1Q8N6N6 113 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR1J4Q8NGS1 313 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 JADE3Q92613 823 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 EXO5Q9H790 373 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 NEUROD4Q9HD90 331 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ACKR4Q9NPB9 350 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 FBXO34Q9NWN3 711 aa24.62■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SUSD5O60279 629 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 FADS1O60427 444 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 HCN1O60741 890 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 DIAPH2O60879 1101 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 TRAPPC6AO75865 159 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 EVI2BP34910 448 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 EIPR1Q53HC9 387 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CCNJQ5T5M9 372 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 FIGNL1Q6PIW4 674 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 MARVELD2Q8N4S9 558 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 DMRTA2Q96SC8 542 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 FBXL2Q9UKC9 423 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 KCNE3Q9Y6H6 103 aa24.61■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 TTC36A6NLP5 189 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 E9PBE3 544 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 HPNP05981 417 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PRIM2P49643 509 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 DGKQP52824 942 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 VPS26BQ4G0F5 336 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 GXYLT1Q4G148 440 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR56A1Q8NGH5 318 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 NEIL3Q8TAT5 605 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CDS1Q92903 461 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SERHL2Q9H4I8 314 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SLC6A5Q9Y345 797 aa24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 KCNK2O95069 426 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 KCNH1O95259 989 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 UTS2O95399 124 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 C1QCP02747 245 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ALOX5P09917 674 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 TOMM20Q15388 145 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CDSNQ15517 529 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 GRAMD1BQ3KR37 738 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 EPGNQ6UW88 154 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 APOOLQ6UXV4 268 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR4A15Q8NGL6 344 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 FAM110BQ8TC76 370 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 SFXN5Q8TD22 340 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 NCKAP5O14513 1909 aa24.59■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 HECTD1Q9ULT8 2610 aa24.58■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 OR14I1A6ND48 311 aa24.58■■□□□ 1.53
TPGS1-201ENST00000359315 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
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