RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 ABLIM3O94929 683 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FESP07332 822 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MAGEA8P43361 318 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MPP2Q14168 576 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 STK11Q15831 433 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MFSD8Q8NHS3 518 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FEVQ99581 238 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CMAHPQ9Y471 501 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CD79AP11912 226 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 TPTEP56180 551 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RAB15P59190 212 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 MANEAQ5SRI9 462 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FAM205BPQ63HN1 556 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KCTD9Q7L273 389 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 NAGSQ8N159 534 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 ASB11Q8WXH4 323 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 KCND3Q9UK17 655 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GGT1P19440 569 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 GRPRP30550 384 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 BNIP3Q12983 259 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 POTEKPQ9BYX7 375 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 RAB9BQ9NP90 201 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 CCL26Q9Y258 94 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRO-202ENST00000348962 SH3D21A4FU49 640 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CKMT1AP12532 417 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HSD17B1P14061 328 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TCN2P20062 427 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TNFSF4P23510 183 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ACVR1BP36896 505 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SPHARQ15513 63 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 KDM1BQ8NB78 822 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PINK1Q9BXM7 581 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 NGBQ9NPG2 151 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TREX1Q9NSU2 369 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MROH6A6NGR9 719 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SNAP29O95721 258 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MYOGP15173 224 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MSX1P28360 303 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CDKN2CP42773 168 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RSU1Q15404 277 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 XKR5Q6UX68 686 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MAL2Q969L2 176 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HDAC8Q9BY41 377 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 EURLQ9NYK6 297 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MEGF11A6BM72 1044 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 RASAL1O95294 804 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM225BP0DP42 221 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF595Q8IYB9 648 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ARRDC3Q96B67 414 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ALG5Q9Y673 324 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CLIC3O95833 236 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 C1SP09871 688 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 FUT1P19526 365 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CD27P26842 260 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MTNR1AP48039 350 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HSD17B7P56937 341 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 MYLIPQ8WY64 445 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CHD4Q14839 1912 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 VEZF1Q14119 521 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 PDSS2Q86YH6 399 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 FAM46BQ96A09 425 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 TAMM41Q96BW9 452 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 EXTL2Q9UBQ6 330 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 SMIM30A4D0T7 59 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRO-202ENST00000348962 H0YGG7 62 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms