RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 SPCS2Q15005 226 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 AHSA2Q719I0 299 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TAGAPQ8N103 731 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PMEPA1Q969W9 287 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 YIPF6Q96EC8 236 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 COL21A1Q96P44 957 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 APMAPQ9HDC9 416 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MAGEB3O15480 346 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FADS2O95864 444 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 IDH2P48735 452 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PRKAG1P54619 331 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR19Q15760 415 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MOGQ16653 247 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 C18orf63Q68DL7 685 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PAQR7Q86WK9 346 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PARP8Q8N3A8 854 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SCAIQ8N9R8 606 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC41A2Q96JW4 573 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 OR6C1Q96RD1 312 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BCL7BQ9BQE9 202 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 COPS4Q9BT78 406 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM60AQ9NP50 221 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SEMA5BQ9P283 1151 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TMCC3Q9ULS5 477 aa14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PROM1O43490 865 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 AIFM1O95831 613 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 INHBBP09529 407 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CERS1P27544 350 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMB9P28065 219 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL17Q6TDP4 642 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM64Q6YI46 380 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT73Q86Y46 540 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC103Q8IW40 242 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GGHQ92820 318 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 MYDGFQ969H8 173 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE7BQ9NP56 450 aa14.79□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BRINP1O60477 761 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CLPXO76031 633 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GABARAPO95166 117 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 GABRB1P18505 474 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP2R1BP30154 601 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 PTGER1P34995 402 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KHKP50053 298 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TEKQ02763 1124 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 DUSP2Q05923 314 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 TGM3Q08188 693 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 KMT5CQ86Y97 462 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 D2HGDHQ8N465 521 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 BMPERQ8N8U9 685 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SFXN5Q8TD22 340 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 NXPE2Q96DL1 559 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.78□□□□□ -0.04
TSNARE1-201ENST00000307180 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms