RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SPHK1Q9NYA1 384 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SATB2Q9UPW6 733 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZZEF1O43149 2961 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM201Q5SNT2 666 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 AGTRAPQ6RW13 159 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 NLGN4XQ8N0W4 816 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52J3Q8NH60 311 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53INP1Q96A56 240 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A19Q9HC21 320 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TBC1D24Q9ULP9 559 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAP00813 363 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CATP04040 527 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ETFAP13804 333 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CCKBRP32239 447 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4F2P78329 520 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RUNX1T1Q06455 604 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE7AQ13946 482 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ATAD3CQ5T2N8 411 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM20CQ8IXL6 584 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8H2Q8N162 312 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SIMC1Q8NDZ2 872 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR7G3Q8NG95 312 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR56A3Q8NH54 315 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF5Q8WWW0 418 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5M11Q96RB7 305 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K3Q99759 626 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPNQ9BXN1 380 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GPATCH2Q9NW75 528 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R9Q9NYW1 312 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTBP11277 2137 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 DSPPQ9NZW4 1301 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ACACAQ13085 2346 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPXA8MT69 81 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CCL4P13236 92 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP69Q49AA0 526 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC4Q5T2S8 1044 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PLXDC1Q8IUK5 500 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 NFKBIDQ8NI38 313 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.538e-53■■■□□ 14.8
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CAPNS1-201ENST00000246533 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 KCND3Q9UK17 655 aa24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 GPX5O75715 221 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ARAFP10398 606 aa24.62■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 LSSP48449 732 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 HBA1P69905 142 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SSX1Q16384 188 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MED27Q6P2C8 311 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR9Q2Q8NGE9 314 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OPALINQ96PE5 141 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MND1Q9BWT6 205 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GSAPA4D1B5 854 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 HMX3A6NHT5 357 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF10O60809 474 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OPN1SWP03999 348 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 IFNW1P05000 195 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QTNF9P0C862 333 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGP20916 626 aa24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 HUS1BQ8NHY5 278 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 FOPNLQ96NB1 174 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNS3Q9BQ31 491 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 STUB1Q9UNE7 303 aa24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 KCNE2Q9Y6J6 123 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SCO2O43819 266 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 LGI1O95970 557 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1E2P47887 323 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CRISP3P54108 245 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 NAE1Q13564 534 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 COX20Q5RI15 118 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL17Q6TDP4 642 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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