RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CRELD1Q96HD1 420 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AIFM2Q9BRQ8 373 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SPATA2Q9UM82 520 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NAV3Q8IVL0 2385 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PPC4 97 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PGRMC2O15173 223 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF806P0C7X5 589 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NR4A1P22736 598 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CD27P26842 260 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GGT2P36268 569 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SMSP52788 366 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CASP6P55212 293 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MCHR1Q99705 422 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SERTAD3Q9UJW9 196 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC22A1O15245 554 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 YY2O15391 372 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DPM1O60762 260 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRAMEF10O60809 474 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLITRK5O94991 958 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TCTE1Q5JU00 501 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 IQCHQ86VS3 1027 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC34A3Q8N130 599 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TEX19Q8NA77 164 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR7D2Q96RA2 312 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HYKKA2RU49 373 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 B4GALT2O60909 372 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 UBXN7O94888 489 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CPMP14384 443 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PIGAP37287 484 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PGDP52209 483 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 USP51Q70EK9 711 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DEFB124Q8NES8 71 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC6A18Q96N87 628 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MBOAT4Q96T53 435 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa9.96□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PRG6 482 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RAB19A4D1S5 217 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 B4GAT1O43505 415 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 STX11O75558 287 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 KLHL18O94889 574 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 OSMP13725 252 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 NUDT6P53370 316 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 RAB14P61106 215 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP14Q86UN6 197 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SPARTQ8N0X7 666 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 NT5CQ8TCD5 201 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CMKLR1Q99788 373 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CHRDQ9H2X0 955 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 Q9N2J8 555 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 OR5K3A6NET4 321 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 CENPXA8MT69 81 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 HMGN4O00479 90 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 PROM1O43490 865 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 SOX14O95416 240 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 GPR75O95800 540 aa9.96□□□□□ -0.82
PRRX1-201ENST00000239461 TSPAN19P0C672 248 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms