RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM10Q96HG1 83 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 AICDAQ9GZX7 198 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 EHD3Q9NZN3 535 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 OLR1P78380 273 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SNCBQ16143 134 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PPCDCQ96CD2 204 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PLSCR2Q9NRY7 297 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 VAPAQ9P0L0 249 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GTH9 108 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RFXANKO14593 260 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST10O43529 356 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB561P49447 251 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HLCSP50747 726 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 BTG2P78543 158 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A2Q01362 244 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CD163Q86VB7 1156 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RPRMLQ8N4K4 120 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMG1O95456 288 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPIND1P05546 499 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RFC3P40938 356 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SSR2P43308 183 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNIQ14094 377 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FLOT2Q14254 428 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 EMC4Q5J8M3 183 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SULF2Q8IWU5 870 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MSRB3Q8IXL7 192 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL31Q9H511 634 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BP4Q9P0V3 963 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS13CQ709C8 3753 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF407Q9C0G0 2248 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPRSS11DO60235 418 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TOXO94900 526 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 STAMBPO95630 424 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 IL3P08700 152 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGS2P35354 604 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MEOX1P50221 254 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G16P53816 162 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 LIPEQ05469 1076 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB134Q4QY38 66 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RABL3Q5HYI8 236 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP1Q6P2D0 407 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM47BQ8NA70 645 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 PANX1Q96RD7 426 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 UCK2Q9BZX2 261 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG2Q9H553 416 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTR3BQ9P1U1 418 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NAV3Q8IVL0 2385 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX2-6A6NCS4 301 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALT2O60909 372 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GBAP04062 536 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ALOX12P18054 663 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GCKP35557 465 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 GSK3BP49841 420 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 APCDD1LQ8NCL9 501 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRB4Q8NHJ6 448 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MIEF1Q9NQG6 463 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 COQ3Q9NZJ6 369 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF6Q9Y252 685 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB4Q9Y574 426 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC13O75165 2243 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 AQP12BA6NM10 295 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 HS6ST1O60243 411 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-216ENST00000628306 MSX1P28360 303 aa22.25■■□□□ 1.15
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