RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 CDKL1Q00532 357 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 POU4F2Q12837 409 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZNF235Q14590 738 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 REP15Q6BDI9 236 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.2□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.2□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ELOVL6Q9H5J4 265 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CWH43Q9H720 699 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PPT2Q9UMR5 302 aa7.2□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 COL4A6Q14031 1691 aa7.2□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 GPR39O43194 453 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 ZMPSTE24O75844 475 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 NQO2P16083 231 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 TP53BP2Q13625 1128 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RAB39AQ14964 217 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 SVOPQ8N4V2 548 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 PLD4Q96BZ4 506 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 VN1R3Q9BXE9 311 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 REG4Q9BYZ8 158 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CSTL1Q9H114 145 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 SEC14L2O76054 403 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 C5AR1P21730 350 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 CD1BP29016 333 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CDH15P55291 814 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 TMEM198Q66K66 360 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 C16orf89Q6UX73 402 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CHST9Q7L1S5 443 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-244ENST00000602516 OR4L1Q8NH43 312 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 LRRN3Q9H3W5 708 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 NIPAL2Q9H841 368 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.19□□□□□ -1.26
HCG18-244ENST00000602516 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
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