RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ZG16BQ96DA0 208 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 WFDC6Q9BQY6 131 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 UCK2Q9BZX2 261 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.88■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 AGAP5A6NIR3 686 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 H3BMH7 237 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CPNE6O95741 557 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 AGXTP21549 392 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SEPHS1P49903 392 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CFHR1Q03591 330 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 COX10Q12887 443 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 NR0B2Q15466 257 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SHISA5Q8N114 240 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 OR52R1Q8NGF1 315 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 OR4C6Q8NH72 309 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SLC7A13Q8TCU3 470 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SERTAD3Q9UJW9 196 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CEPT1Q9Y6K0 416 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 AP3D1O14617 1153 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 NME6O75414 186 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 S1PR1P21453 382 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 HOXD12P35452 270 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 IFNGR2P38484 337 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 TAS2R41P59536 307 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ST3GAL3Q11203 375 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SLC38A4Q969I6 547 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 OR1F2PQ96R84 312 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 RBCK1Q9BYM8 510 aa20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 KIAA0513O60268 411 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 MPZL2O60487 215 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 OSMP13725 252 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CSF2RBP32927 897 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 GABRA3P34903 492 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CRISP1P54107 249 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ILKQ13418 452 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 NPTX1Q15818 432 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CD300LDQ6UXZ3 194 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 P3H2Q8IVL5 708 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SAP25Q8TEE9 199 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 NODALQ96S42 347 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 NDC1Q9BTX1 674 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 DUSP21Q9H596 190 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 FANCEQ9HB96 536 aa20.86■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 PRAMEF2O60811 474 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 POU2F1P14859 743 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CDC42P60953 191 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 KCNAB1Q14722 419 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 TRAM2Q15035 370 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SEC23BQ15437 767 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 PODNL1Q6PEZ8 512 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 SPARTQ8N0X7 666 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 PIGKQ92643 395 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 CHST2Q9Y4C5 530 aa20.85■□□□□ 0.93
USP36-218ENST00000590546 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms