RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PIGA	P37287	484 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	RFC3	P40938	356 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	KCNJ2	P63252	427 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	DESI1	Q6ICB0	168 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	GALNT10	Q86SR1	603 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	BCORP1	Q8N888	145 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	22.93	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0G2JMM0	328 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PPB8	328 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1W2PRS3	328 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	HS6ST1	O60243	411 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	UGT2B11	O75310	529 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NKX2-2	O95096	273 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NAGA	P17050	411 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	DNASE1L1	P49184	302 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PLGLB1	Q02325	96 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	OR7D2	Q96RA2	312 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SERHL	Q9NQF3	203 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	MRGBP	Q9NV56	204 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CNIH4	Q9P003	139 aa		22.92	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	ANGPT2	O15123	496 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	ABCB7	O75027	752 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	TLE1	Q04724	770 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	EFR3A	Q14156	821 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	GRHL3	Q8TE85	626 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	TMCO6	Q96DC7	493 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	STAC	Q99469	402 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	DOHH	Q9BU89	302 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	OR51I1	Q9H343	314 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SAR1A	Q9NR31	198 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	DEPP	Q9NTK1	212 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		22.91	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN2	O60636	221 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CYP4B1	P13584	511 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CD1E	P15812	388 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CNR1	P21554	472 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	KHK	P50053	298 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PNLIPRP2	P54317	469 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	GTDC1	Q4AE62	458 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SAXO2	Q658L1	398 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF605	Q86T29	641 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	RNF130	Q86XS8	419 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	OR2M7	Q8NG81	312 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	GTF2H4	Q92759	462 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	HGD	Q93099	445 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NEURL3	Q96EH8	262 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	SLC35A4	Q96G79	324 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	TAAR6	Q96RI8	345 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NODAL	Q96S42	347 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PIGU	Q9H490	435 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	NCKAP5	O14513	1909 aa		22.9	■■□□□ 1.26
GPS1-223	ENST00000584229	ASPDH	A6ND91	283 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	KALRN	O60229	2985 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	MASP1	P48740	699 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	TRPC1	P48995	793 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	KLF10	Q13118	480 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	FRMD6	Q96NE9	622 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	BTBD2	Q9BX70	525 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		22.89	■■□□□ 1.25
GPS1-223	ENST00000584229	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		22.89	■■□□□ 1.25

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