RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ADO	Q96SZ5	270 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF175	Q9Y473	711 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PLCE1	Q9P212	2302 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RNF212B	A8MTL3	300 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169		H0YC42	278 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC188	H7C350	402 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OR7A17	O14581	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PLAU	P00749	431 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CT45A8	P0DMV1	189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CT45A9	P0DMV2	189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PPP3CB	P16298	524 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PCSK2	P16519	638 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KCNJ5	P48544	419 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	IRF9	Q00978	393 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DMTN	Q08495	405 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PHC2	Q8IXK0	858 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FADS6	Q8N9I5	356 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF675	Q8TD23	568 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL29	Q96CT2	875 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GPR78	Q96P69	363 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NTMT1	Q9BV86	223 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PINK1	Q9BXM7	581 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169		A0A087X1B8	175 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	HS3ST1	O14792	307 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	C2	P06681	752 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NR1H2	P55055	460 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CORO7	P57737	925 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PSPH	P78330	225 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OCRL	Q01968	901 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TRAF3	Q13114	568 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ACAP2	Q15057	778 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	DSN1	Q9H410	356 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	WHRN	Q9P202	907 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	HMX2	A2RU54	273 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	AQP8	O94778	261 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KLHL2	O95198	593 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CTAGE8	P0CG41	777 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	HK1	P19367	917 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	IL12B	P29460	328 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	KRT20	P35900	424 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CCNG1	P51959	295 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CLDN20	P56880	219 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	IFT88	Q13099	833 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NAB1	Q13506	487 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	PON3	Q15166	354 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	SGO1	Q5FBB7	561 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-238	ENST00000568169	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		10.22	□□□□□ -0.77

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