RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539498.1

RAN-209, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAN, Length 1,659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-209	ENST00000539498	YES1	P07947	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SFTPB	P07988	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	HMBS	P08397	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ADRA1A	P35348	466 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CETN2	P41208	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ARPP19	P56211	112 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	MYL6	P60660	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	HSF2	Q03933	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	GPAT3	Q53EU6	434 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	VASH2	Q86V25	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	P3H4	Q92791	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TSG101	Q99816	390 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SSX3	Q99909	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	AGPAT1	Q99943	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ASB7	Q9H672	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	OR1A2	Q9Y585	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ANK1	P16157	1881 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	PIR	O00625	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	GPRIN2	O60269	458 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	PALM	O75781	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TXNDC12	O95881	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CALCB	P10092	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CLU	P10909	449 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	DNA2	P51530	1060 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	BTG1	P62324	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	IL24	Q13007	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SNTA1	Q13424	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SNX1	Q13596	522 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	KYAT1	Q16773	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	MISP	Q8IVT2	679 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CD302	Q8IX05	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ZBP1	Q9H171	429 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CIT	O14578	2027 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	2e-6	■■■■■ 43.1
RAN-209	ENST00000539498	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CYB561D2	O14569	222 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TNNC2	P02585	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	RALA	P11233	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	FCGR1A	P12314	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	ANPEP	P15144	967 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	CCKBR	P32239	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	GEM	P55040	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	HYAL1	Q12794	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	KEAP1	Q14145	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAN-209	ENST00000539498	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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