RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	TOM1L1	O75674	476 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	IGSF6	O95976	241 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	THY1	P04216	161 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PTPN6	P29350	595 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	HMGCL	P35914	325 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	HMGCS2	P54868	508 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	HTD2	P86397	168 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	FUT7	Q11130	342 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	RUNX3	Q13761	415 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	DPYS	Q14117	519 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	LTB4R	Q15722	352 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	CD226	Q15762	336 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ATRAID	Q6UW56	229 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	MISP	Q8IVT2	679 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	GPD1L	Q8N335	351 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL14	Q8N4G2	192 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	CERS5	Q8N5B7	392 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	BCORP1	Q8N888	145 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	TSPY26P	Q9H489	355 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	GHRL	Q9UBU3	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAMTS12	P58397	1594 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284		A0A1W2PQ72	361 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	C11orf98	E9PRG8	122 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	SDC3	O75056	442 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	VPS26A	O75436	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	CA3	P07451	260 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	HTR5A	P47898	357 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	NOV	P48745	357 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	GPC3	P51654	580 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGDIA	P52565	204 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	IST1	P53990	364 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PRKCE	Q02156	737 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	HSF2	Q03933	536 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PNCK	Q6P2M8	343 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	VPS36	Q86VN1	386 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXL16	Q8N461	479 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	TBCK	Q8TEA7	893 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	GIPC3	Q8TF64	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	MCHR2	Q969V1	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	CARD6	Q9BX69	1037 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	CENPM	Q9NSP4	180 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	NUP160	Q12769	1436 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	TTC26	A0AVF1	554 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284		E9PMD0	336 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284		H0YL77	283 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284		H3BTX0	84 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	SGK494	L7N484	410 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PDXK	O00764	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	RHBDL1	O75783	438 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	DIRAS3	O95661	229 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	IFNB1	P01574	187 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	DES	P17661	470 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	PTMS	P20962	102 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRK-215	ENST00000498284	KRTAP10-3	P60369	221 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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