RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468826.2

COCH-204, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-204ENST00000468826 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6.56□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.56□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.56□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.56□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 WDR45Q9Y484 360 aa6.56□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 A0A1W2PPC4 97 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SGK494L7N484 410 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PRKYO43930 277 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GPR75O95800 540 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CTSBP07858 339 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ACP2P11117 423 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ST6GAL1P15907 406 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 IFNA8P32881 189 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SOX18P35713 384 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SLC15A1P46059 708 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GIPRP48546 466 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SERPINB10P48595 397 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 RGS6P49758 472 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ST3GAL3Q11203 375 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GINS1Q14691 196 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 NR1D2Q14995 579 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 TRAM2Q15035 370 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 NDUFA9Q16795 377 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MANEAQ5SRI9 462 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ACSM5Q6NUN0 579 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SYT13Q7L8C5 426 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 RRM2BQ7LG56 351 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 C11orf74Q86VG3 221 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PARGQ86W56 976 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PEX5LQ8IYB4 626 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MSANTD3Q96H12 275 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 OR5M11Q96RB7 305 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 LRRC61Q9BV99 259 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 FAM60AQ9NP50 221 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MYO10Q9HD67 2058 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 FAM170BA6NMN3 283 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CLDN25C9JDP6 229 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 AP3D1O14617 1153 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MAGEB3O15480 346 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MBTPS2O43462 519 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 RDH16O75452 317 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ATP1B1P05026 303 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ALOX5P09917 674 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SRFP11831 508 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GSTM3P21266 225 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CDH3P22223 829 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 BMP8BP34820 402 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 IDUAP35475 653 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 IFNGR2P38484 337 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PCYT1AP49585 367 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 BLKP51451 505 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CDK5Q00535 292 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 MAP4K2Q12851 820 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ITGADQ13349 1161 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GPR68Q15743 365 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 FHL5Q5TD97 284 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 KIF18BQ86Y91 864 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 SLC34A3Q8N130 599 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GJD3Q8N144 294 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 CA13Q8N1Q1 262 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
COCH-204ENST00000468826 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms