RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LETMD1Q6P1Q0 360 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 B3GNT7Q8NFL0 401 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 OR51J1Q9H342 316 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RDH14Q9HBH5 336 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ACOT13Q9NPJ3 140 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CNIH4Q9P003 139 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 POU2F3Q9UKI9 436 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CPED1A4D0V7 1026 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TNFSF12O43508 249 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CTSAP10619 480 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CASRP41180 1078 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RAB11BQ15907 218 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 BEST4Q8NFU0 473 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 BCL7BQ9BQE9 202 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 HAPLN2Q9GZV7 340 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 NAV1Q8NEY1 1877 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GXYLT2A0PJZ3 443 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RAD1O60671 282 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LATS1O95835 1130 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 WNT4P56705 351 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 DCUN1D4Q92564 292 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 BOCQ9BWV1 1114 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MYH10P35580 1976 aa13.75□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 M0R3H8 397 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PBX2P40425 430 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ALDH3B1P43353 468 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 KCNJ5P48544 419 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 FGL2Q14314 439 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CRTC1Q6UUV9 634 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C12orf40Q86WS4 652 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM156Q8N614 296 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 NINJ1Q92982 152 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C1orf74Q96LT6 269 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM68Q96MH6 324 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 HPGDSO60760 199 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TSPAN15O95858 294 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TNFP01375 233 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 DPP6P42658 865 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM225Q6GV28 225 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CYB561A3Q8NBI2 242 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 FAM46BQ96A09 425 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SAMD8Q96LT4 415 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 NEDD4LQ96PU5 975 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GSTO2Q9H4Y5 243 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ENPP4Q9Y6X5 453 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 COL18A1P39060 1754 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ADAMTS4O75173 837 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 POU4F2Q12837 409 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 BTN1A1Q13410 526 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TP53I3Q53FA7 332 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 AGAP6Q5VW22 663 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 GTF2H4Q92759 462 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ARL11Q969Q4 196 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SGTBQ96EQ0 304 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 AGAP4Q96P64 663 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 VAPAQ9P0L0 249 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RIMS3Q9UJD0 308 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 BACE2Q9Y5Z0 518 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TXNL1O43396 289 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LIPCP11150 499 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 DLSTP36957 453 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 OR14K1Q8NGZ2 314 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 SPHK2Q9NRA0 654 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RPS2P15880 293 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RORAP35398 523 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MC2RQ01718 297 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 RGNQ15493 299 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 ACBD4Q8NC06 268 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 TOX2Q96NM4 488 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRU-204ENST00000428026 MFFQ9GZY8 342 aa13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms