RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP5Q16690 384 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDHQ8IZJ6 230 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MGLLQ99685 303 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR174Q9BXC1 333 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKYO43930 277 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LDB3O75112 727 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNYL3P0C7X3 344 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACP2P11117 423 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DBTP11182 482 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCYT1AP49585 367 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK5Q00535 292 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST3GAL3Q11203 375 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOC2BQ14184 412 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MANEAQ5SRI9 462 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FHL5Q5TD97 284 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF18BQ86Y91 864 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5T3Q8NGG3 340 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR51E2Q9H255 320 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL21RQ9HBE5 538 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR45Q9Y484 360 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPACA6W5XKT8 324 aa17.49■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM170BA6NMN3 283 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYR61O00622 381 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGF17O60258 216 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP1B1P05026 303 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCM2P0CE71 109 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIMK1P53667 647 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXC5Q00444 222 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RGS21Q2M5E4 152 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACSM5Q6NUN0 579 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP43Q70EL4 1123 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MFSD4AQ8N468 514 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM26EQ8N5C1 309 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSNK1A1LQ8N752 337 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD19PQ9H560 264 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR5K3A6NET4 321 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTSEP14091 401 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNGR2P38484 337 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHC2P98077 582 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HHEXQ03014 270 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITGADQ13349 1161 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A30Q5SVS4 291 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF438Q7Z4V0 828 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSANTD3Q96H12 275 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM80Q96HE8 168 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSSK6Q9BXA6 273 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EGLN3Q9H6Z9 239 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa17.48■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP3D1O14617 1153 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTN1O95631 604 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BMP4P12644 408 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFNA8P32881 189 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMSP52788 366 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf61Q13536 156 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCF4Q15080 339 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSTQ16762 297 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYT14P1Q58G82 188 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf48Q6RUI8 117 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OOSP2Q86WS3 158 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PEX5LQ8IYB4 626 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCFD2Q8NI22 146 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOK4Q8TEW6 326 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SDF2Q99470 211 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIGUQ9H490 435 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNIH4Q9P003 139 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCRTR1O43613 425 aa17.46■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR75O95800 540 aa17.46■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFNB1P98172 346 aa17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms