RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414435.1

AC004000.1-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC004000.1, Length 433 nt, Biotype sense intronic.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004000.1-201ENST00000414435 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 WDR93Q6P2C0 686 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 LIX1LQ8IVB5 337 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 PM20D2Q8IYS1 436 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 CLYBLQ8N0X4 340 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 TNIP2Q8NFZ5 429 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 NTNG2Q96CW9 530 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 SLC35A4Q96G79 324 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 TSSK3Q96PN8 268 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 TRIB1Q96RU8 372 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 CCT7Q99832 543 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 TUBB1Q9H4B7 451 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 TRAF6Q9Y4K3 522 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 WIF1Q9Y5W5 379 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.65□□□□□ -0.7
AC004000.1-201ENST00000414435 PLOD2O00469 737 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PIP5K1BO14986 540 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 LSM1O15116 133 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 NPHS1O60500 1241 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 CYP4B1P13584 511 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 CREB1P16220 341 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 IGFBP2P18065 325 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SDC1P18827 310 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 BMP5P22003 454 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 GPC1P35052 558 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 RFX3P48380 749 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PSG6Q00889 435 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SRYQ05066 204 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 DECR1Q16698 335 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 CYP27C1Q4G0S4 372 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 NHSL2Q5HYW2 709 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SEM1Q6ZVN7 128 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 OR2L13Q8N349 312 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 ACBD4Q8NC06 268 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TWIST2Q8WVJ9 160 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 CAVIN3Q969G5 261 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PPCDCQ96CD2 204 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 ELP4Q96EB1 424 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 REEP4Q9H6H4 257 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 Q9N2J8 555 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 EQTNQ9NQ60 294 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TAS2R10Q9NYW0 307 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SH3BP4Q9P0V3 963 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 FBXL2Q9UKC9 423 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 CBLCQ9ULV8 474 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 MED12Q93074 2177 aa10.64□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 NPIPB8E9PQR5 432 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SCO2O43819 266 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PEX11AO75192 247 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 ACTL6AO96019 429 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 IL2RAP01589 272 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 FGF4P08620 206 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 BCKDHAP12694 445 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 GRK2P25098 689 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PRKAG1P54619 331 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 KRTAP10-9P60411 292 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 MYBPHQ13203 477 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 GAB1Q13480 694 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 UGT3A2Q3SY77 523 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 KRT71Q3SY84 523 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SZRD1Q7Z422 152 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 IFNEQ86WN2 208 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 LACC1Q8IV20 430 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TRIM42Q8IWZ5 723 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 NAXEQ8NCW5 288 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 C14orf79Q96F83 325 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PARD6BQ9BYG5 372 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 MCCC2Q9HCC0 563 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 GIMAP2Q9UG22 337 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 DKKL1Q9UK85 242 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TMED5Q9Y3A6 229 aa10.63□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 HCFC1P51610 2035 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 SPG11Q96JI7 2443 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 C17orf51A8MQB3 221 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 TMEM114B3SHH9 223 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 H0Y3Z8 333 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 DVL2O14641 736 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PSMG1O95456 288 aa10.62□□□□□ -0.71
AC004000.1-201ENST00000414435 PRPS2P11908 318 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms