RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ASB4Q9Y574 426 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MIA3Q5JRA6 1907 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NUP98P52948 1817 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TSPY2A6NKD2 308 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 F8W036 122 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PDXKO00764 312 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RAD51BO15315 384 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SPOPO43791 374 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PRPSAP2O60256 369 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NOL3O60936 208 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PDE9AO76083 593 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SUPT7LO94864 414 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SLITRK3O94933 977 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CSPG5O95196 566 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 APOC1P02654 83 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 C1QBP02746 253 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ALPPP05187 535 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ASNSP08243 561 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OR52Z1P0C646 297 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TSPY3P0CV98 308 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TSPY8P0CW00 308 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RRASP10301 218 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CKMT2P17540 419 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RAB3AP20336 220 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GLRA2P23416 452 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CRHBPP24387 322 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-DMAP28067 261 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEA6P43360 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MAGEA12P43365 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ERFP50548 548 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TPMTP51580 245 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK12P53778 367 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 VBP1P61758 197 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TSPY1Q01534 308 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 BFSP1Q12934 665 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 KCNJ11Q14654 390 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 KCTD2Q14681 263 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TSC22D1Q15714 1073 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TAZQ16635 292 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 DGUOKQ16854 277 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TCTN1Q2MV58 587 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 IQCCQ4KMZ1 466 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TEX30Q5JUR7 227 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 CLLU1Q5K131 121 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FRG2Q64ET8 278 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 UNC5DQ6UXZ4 953 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 STRADAQ7RTN6 431 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 HORMAD1Q86X24 394 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NRROSQ86YC3 692 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 BEST3Q8N1M1 668 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF611Q8N823 705 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF781Q8N8C0 355 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 NAT8LQ8N9F0 302 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OR7G3Q8NG95 312 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OR6S1Q8NH40 331 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 OR8K5Q8NH50 307 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GANCQ8TET4 914 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 C1orf54Q8WWF1 131 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V1E2Q96A05 226 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RAD51AP1Q96B01 352 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC32Q9BV29 185 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 FTHL17Q9BXU8 183 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 REG4Q9BYZ8 158 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 MMP27Q9H306 513 aa3.24□□□□□ -1.89
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PTPRC-202ENST00000367364 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 COG4Q9H9E3 785 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 IFT46Q9NQC8 304 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 POLE3Q9NRF9 147 aa3.24□□□□□ -1.89
PTPRC-202ENST00000367364 GIMAP4Q9NUV9 329 aa3.24□□□□□ -1.89
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